Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSC3

RBM43, RNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 357 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM43Q6ZSC3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBM43Q6ZSC3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBM43Q6ZSC3 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBM43Q6ZSC3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBM43Q6ZSC3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBM43Q6ZSC3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RBM43Q6ZSC3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBM43Q6ZSC3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBM43Q6ZSC3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBM43Q6ZSC3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBM43Q6ZSC3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RBM43Q6ZSC3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RBM43Q6ZSC3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RBM43Q6ZSC3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RBM43Q6ZSC3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RBM43Q6ZSC3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RBM43Q6ZSC3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RBM43Q6ZSC3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RBM43Q6ZSC3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RBM43Q6ZSC3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RBM43Q6ZSC3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RBM43Q6ZSC3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RBM43Q6ZSC3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBM43Q6ZSC3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBM43Q6ZSC3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBM43Q6ZSC3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBM43Q6ZSC3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBM43Q6ZSC3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBM43Q6ZSC3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBM43Q6ZSC3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RBM43Q6ZSC3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBM43Q6ZSC3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RBM43Q6ZSC3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBM43Q6ZSC3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBM43Q6ZSC3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBM43Q6ZSC3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBM43Q6ZSC3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBM43Q6ZSC3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBM43Q6ZSC3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RBM43Q6ZSC3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBM43Q6ZSC3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBM43Q6ZSC3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBM43Q6ZSC3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBM43Q6ZSC3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBM43Q6ZSC3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBM43Q6ZSC3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBM43Q6ZSC3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBM43Q6ZSC3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBM43Q6ZSC3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBM43Q6ZSC3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBM43Q6ZSC3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBM43Q6ZSC3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBM43Q6ZSC3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBM43Q6ZSC3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBM43Q6ZSC3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBM43Q6ZSC3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBM43Q6ZSC3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBM43Q6ZSC3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBM43Q6ZSC3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBM43Q6ZSC3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBM43Q6ZSC3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RBM43Q6ZSC3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBM43Q6ZSC3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBM43Q6ZSC3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBM43Q6ZSC3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RBM43Q6ZSC3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RBM43Q6ZSC3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RBM43Q6ZSC3 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RBM43Q6ZSC3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RBM43Q6ZSC3 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RBM43Q6ZSC3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RBM43Q6ZSC3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RBM43Q6ZSC3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RBM43Q6ZSC3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RBM43Q6ZSC3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RBM43Q6ZSC3 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RBM43Q6ZSC3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RBM43Q6ZSC3 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RBM43Q6ZSC3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RBM43Q6ZSC3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RBM43Q6ZSC3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RBM43Q6ZSC3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RBM43Q6ZSC3 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RBM43Q6ZSC3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RBM43Q6ZSC3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RBM43Q6ZSC3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RBM43Q6ZSC3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RBM43Q6ZSC3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RBM43Q6ZSC3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RBM43Q6ZSC3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RBM43Q6ZSC3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RBM43Q6ZSC3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RBM43Q6ZSC3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RBM43Q6ZSC3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RBM43Q6ZSC3 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RBM43Q6ZSC3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RBM43Q6ZSC3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RBM43Q6ZSC3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RBM43Q6ZSC3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RBM43Q6ZSC3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
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