Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN7

PDZRN4, PDZ domain-containing RING finger protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN4Q6ZMN7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDZRN4Q6ZMN7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDZRN4Q6ZMN7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDZRN4Q6ZMN7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDZRN4Q6ZMN7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDZRN4Q6ZMN7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PDZRN4Q6ZMN7 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDZRN4Q6ZMN7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDZRN4Q6ZMN7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDZRN4Q6ZMN7 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDZRN4Q6ZMN7 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDZRN4Q6ZMN7 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDZRN4Q6ZMN7 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDZRN4Q6ZMN7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDZRN4Q6ZMN7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDZRN4Q6ZMN7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDZRN4Q6ZMN7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDZRN4Q6ZMN7 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PDZRN4Q6ZMN7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDZRN4Q6ZMN7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDZRN4Q6ZMN7 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDZRN4Q6ZMN7 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDZRN4Q6ZMN7 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDZRN4Q6ZMN7 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDZRN4Q6ZMN7 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDZRN4Q6ZMN7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDZRN4Q6ZMN7 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDZRN4Q6ZMN7 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDZRN4Q6ZMN7 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDZRN4Q6ZMN7 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDZRN4Q6ZMN7 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDZRN4Q6ZMN7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDZRN4Q6ZMN7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDZRN4Q6ZMN7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDZRN4Q6ZMN7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDZRN4Q6ZMN7 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDZRN4Q6ZMN7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PDZRN4Q6ZMN7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDZRN4Q6ZMN7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDZRN4Q6ZMN7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDZRN4Q6ZMN7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDZRN4Q6ZMN7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDZRN4Q6ZMN7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDZRN4Q6ZMN7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDZRN4Q6ZMN7 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDZRN4Q6ZMN7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDZRN4Q6ZMN7 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDZRN4Q6ZMN7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PDZRN4Q6ZMN7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDZRN4Q6ZMN7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDZRN4Q6ZMN7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDZRN4Q6ZMN7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDZRN4Q6ZMN7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDZRN4Q6ZMN7 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDZRN4Q6ZMN7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDZRN4Q6ZMN7 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDZRN4Q6ZMN7 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDZRN4Q6ZMN7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PDZRN4Q6ZMN7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PDZRN4Q6ZMN7 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDZRN4Q6ZMN7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PDZRN4Q6ZMN7 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDZRN4Q6ZMN7 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDZRN4Q6ZMN7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDZRN4Q6ZMN7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDZRN4Q6ZMN7 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDZRN4Q6ZMN7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDZRN4Q6ZMN7 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDZRN4Q6ZMN7 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDZRN4Q6ZMN7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDZRN4Q6ZMN7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDZRN4Q6ZMN7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDZRN4Q6ZMN7 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDZRN4Q6ZMN7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDZRN4Q6ZMN7 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDZRN4Q6ZMN7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDZRN4Q6ZMN7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDZRN4Q6ZMN7 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDZRN4Q6ZMN7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDZRN4Q6ZMN7 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDZRN4Q6ZMN7 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDZRN4Q6ZMN7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDZRN4Q6ZMN7 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDZRN4Q6ZMN7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDZRN4Q6ZMN7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDZRN4Q6ZMN7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PDZRN4Q6ZMN7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PDZRN4Q6ZMN7 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDZRN4Q6ZMN7 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDZRN4Q6ZMN7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDZRN4Q6ZMN7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDZRN4Q6ZMN7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms