Protein–RNA interactions for Protein: Q6YBV0

SLC36A4, Proton-coupled amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC36A4Q6YBV0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC36A4Q6YBV0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC36A4Q6YBV0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC36A4Q6YBV0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC36A4Q6YBV0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC36A4Q6YBV0 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC36A4Q6YBV0 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC36A4Q6YBV0 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC36A4Q6YBV0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC36A4Q6YBV0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC36A4Q6YBV0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC36A4Q6YBV0 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC36A4Q6YBV0 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC36A4Q6YBV0 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC36A4Q6YBV0 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC36A4Q6YBV0 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC36A4Q6YBV0 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC36A4Q6YBV0 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC36A4Q6YBV0 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC36A4Q6YBV0 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC36A4Q6YBV0 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC36A4Q6YBV0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC36A4Q6YBV0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC36A4Q6YBV0 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC36A4Q6YBV0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC36A4Q6YBV0 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC36A4Q6YBV0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SLC36A4Q6YBV0 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC36A4Q6YBV0 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC36A4Q6YBV0 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC36A4Q6YBV0 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC36A4Q6YBV0 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC36A4Q6YBV0 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC36A4Q6YBV0 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC36A4Q6YBV0 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC36A4Q6YBV0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC36A4Q6YBV0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC36A4Q6YBV0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC36A4Q6YBV0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC36A4Q6YBV0 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC36A4Q6YBV0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC36A4Q6YBV0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC36A4Q6YBV0 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC36A4Q6YBV0 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC36A4Q6YBV0 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC36A4Q6YBV0 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC36A4Q6YBV0 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC36A4Q6YBV0 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC36A4Q6YBV0 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC36A4Q6YBV0 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC36A4Q6YBV0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC36A4Q6YBV0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC36A4Q6YBV0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC36A4Q6YBV0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC36A4Q6YBV0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC36A4Q6YBV0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC36A4Q6YBV0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC36A4Q6YBV0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC36A4Q6YBV0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC36A4Q6YBV0 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC36A4Q6YBV0 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC36A4Q6YBV0 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC36A4Q6YBV0 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC36A4Q6YBV0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC36A4Q6YBV0 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC36A4Q6YBV0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC36A4Q6YBV0 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC36A4Q6YBV0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC36A4Q6YBV0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC36A4Q6YBV0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC36A4Q6YBV0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC36A4Q6YBV0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC36A4Q6YBV0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC36A4Q6YBV0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC36A4Q6YBV0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC36A4Q6YBV0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC36A4Q6YBV0 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC36A4Q6YBV0 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC36A4Q6YBV0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC36A4Q6YBV0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC36A4Q6YBV0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC36A4Q6YBV0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC36A4Q6YBV0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC36A4Q6YBV0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC36A4Q6YBV0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC36A4Q6YBV0 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC36A4Q6YBV0 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC36A4Q6YBV0 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC36A4Q6YBV0 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC36A4Q6YBV0 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC36A4Q6YBV0 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC36A4Q6YBV0 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC36A4Q6YBV0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC36A4Q6YBV0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC36A4Q6YBV0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC36A4Q6YBV0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC36A4Q6YBV0 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC36A4Q6YBV0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC36A4Q6YBV0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC36A4Q6YBV0 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms