Protein–RNA interactions for Protein: Q6W349

LINC00575, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00575, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00575Q6W349 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00575Q6W349 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00575Q6W349 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00575Q6W349 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00575Q6W349 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00575Q6W349 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00575Q6W349 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00575Q6W349 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00575Q6W349 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00575Q6W349 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00575Q6W349 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00575Q6W349 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00575Q6W349 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
LINC00575Q6W349 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
LINC00575Q6W349 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
LINC00575Q6W349 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
LINC00575Q6W349 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00575Q6W349 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00575Q6W349 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00575Q6W349 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00575Q6W349 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00575Q6W349 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00575Q6W349 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00575Q6W349 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00575Q6W349 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00575Q6W349 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00575Q6W349 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00575Q6W349 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00575Q6W349 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00575Q6W349 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00575Q6W349 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00575Q6W349 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00575Q6W349 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00575Q6W349 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00575Q6W349 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00575Q6W349 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00575Q6W349 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00575Q6W349 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00575Q6W349 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00575Q6W349 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00575Q6W349 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00575Q6W349 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00575Q6W349 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00575Q6W349 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00575Q6W349 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00575Q6W349 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00575Q6W349 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00575Q6W349 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00575Q6W349 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00575Q6W349 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00575Q6W349 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00575Q6W349 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00575Q6W349 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00575Q6W349 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00575Q6W349 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00575Q6W349 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00575Q6W349 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00575Q6W349 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00575Q6W349 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00575Q6W349 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00575Q6W349 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00575Q6W349 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00575Q6W349 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00575Q6W349 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00575Q6W349 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00575Q6W349 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00575Q6W349 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00575Q6W349 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00575Q6W349 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00575Q6W349 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00575Q6W349 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00575Q6W349 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00575Q6W349 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00575Q6W349 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00575Q6W349 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00575Q6W349 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00575Q6W349 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00575Q6W349 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00575Q6W349 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00575Q6W349 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00575Q6W349 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00575Q6W349 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00575Q6W349 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00575Q6W349 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00575Q6W349 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00575Q6W349 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00575Q6W349 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00575Q6W349 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00575Q6W349 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00575Q6W349 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00575Q6W349 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00575Q6W349 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00575Q6W349 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00575Q6W349 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00575Q6W349 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00575Q6W349 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00575Q6W349 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00575Q6W349 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00575Q6W349 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00575Q6W349 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms