Protein–RNA interactions for Protein: Q6V0L0

CYP26C1, Cytochrome P450 26C1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP26C1Q6V0L0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYP26C1Q6V0L0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYP26C1Q6V0L0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYP26C1Q6V0L0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYP26C1Q6V0L0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYP26C1Q6V0L0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYP26C1Q6V0L0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYP26C1Q6V0L0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CYP26C1Q6V0L0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYP26C1Q6V0L0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYP26C1Q6V0L0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYP26C1Q6V0L0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYP26C1Q6V0L0 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYP26C1Q6V0L0 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYP26C1Q6V0L0 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYP26C1Q6V0L0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYP26C1Q6V0L0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CYP26C1Q6V0L0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CYP26C1Q6V0L0 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYP26C1Q6V0L0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CYP26C1Q6V0L0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CYP26C1Q6V0L0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYP26C1Q6V0L0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYP26C1Q6V0L0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYP26C1Q6V0L0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYP26C1Q6V0L0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYP26C1Q6V0L0 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYP26C1Q6V0L0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYP26C1Q6V0L0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYP26C1Q6V0L0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYP26C1Q6V0L0 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYP26C1Q6V0L0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYP26C1Q6V0L0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYP26C1Q6V0L0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CYP26C1Q6V0L0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYP26C1Q6V0L0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYP26C1Q6V0L0 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYP26C1Q6V0L0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYP26C1Q6V0L0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYP26C1Q6V0L0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYP26C1Q6V0L0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYP26C1Q6V0L0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYP26C1Q6V0L0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYP26C1Q6V0L0 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYP26C1Q6V0L0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYP26C1Q6V0L0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CYP26C1Q6V0L0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYP26C1Q6V0L0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYP26C1Q6V0L0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYP26C1Q6V0L0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYP26C1Q6V0L0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYP26C1Q6V0L0 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYP26C1Q6V0L0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYP26C1Q6V0L0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CYP26C1Q6V0L0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYP26C1Q6V0L0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYP26C1Q6V0L0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYP26C1Q6V0L0 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYP26C1Q6V0L0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYP26C1Q6V0L0 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYP26C1Q6V0L0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CYP26C1Q6V0L0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CYP26C1Q6V0L0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CYP26C1Q6V0L0 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CYP26C1Q6V0L0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CYP26C1Q6V0L0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CYP26C1Q6V0L0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CYP26C1Q6V0L0 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CYP26C1Q6V0L0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CYP26C1Q6V0L0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CYP26C1Q6V0L0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CYP26C1Q6V0L0 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CYP26C1Q6V0L0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CYP26C1Q6V0L0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CYP26C1Q6V0L0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CYP26C1Q6V0L0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CYP26C1Q6V0L0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYP26C1Q6V0L0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYP26C1Q6V0L0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYP26C1Q6V0L0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYP26C1Q6V0L0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYP26C1Q6V0L0 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYP26C1Q6V0L0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYP26C1Q6V0L0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CYP26C1Q6V0L0 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYP26C1Q6V0L0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYP26C1Q6V0L0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYP26C1Q6V0L0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYP26C1Q6V0L0 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYP26C1Q6V0L0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYP26C1Q6V0L0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYP26C1Q6V0L0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYP26C1Q6V0L0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYP26C1Q6V0L0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYP26C1Q6V0L0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYP26C1Q6V0L0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYP26C1Q6V0L0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYP26C1Q6V0L0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYP26C1Q6V0L0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CYP26C1Q6V0L0 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms