Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VSTM1Q6UX27 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VSTM1Q6UX27 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VSTM1Q6UX27 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VSTM1Q6UX27 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
VSTM1Q6UX27 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VSTM1Q6UX27 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
VSTM1Q6UX27 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VSTM1Q6UX27 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VSTM1Q6UX27 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VSTM1Q6UX27 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VSTM1Q6UX27 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VSTM1Q6UX27 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VSTM1Q6UX27 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VSTM1Q6UX27 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VSTM1Q6UX27 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VSTM1Q6UX27 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VSTM1Q6UX27 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VSTM1Q6UX27 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VSTM1Q6UX27 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VSTM1Q6UX27 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VSTM1Q6UX27 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VSTM1Q6UX27 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VSTM1Q6UX27 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VSTM1Q6UX27 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VSTM1Q6UX27 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VSTM1Q6UX27 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VSTM1Q6UX27 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VSTM1Q6UX27 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VSTM1Q6UX27 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VSTM1Q6UX27 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VSTM1Q6UX27 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VSTM1Q6UX27 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VSTM1Q6UX27 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VSTM1Q6UX27 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VSTM1Q6UX27 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VSTM1Q6UX27 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
VSTM1Q6UX27 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VSTM1Q6UX27 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VSTM1Q6UX27 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VSTM1Q6UX27 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VSTM1Q6UX27 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VSTM1Q6UX27 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VSTM1Q6UX27 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VSTM1Q6UX27 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VSTM1Q6UX27 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VSTM1Q6UX27 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VSTM1Q6UX27 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VSTM1Q6UX27 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VSTM1Q6UX27 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VSTM1Q6UX27 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VSTM1Q6UX27 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VSTM1Q6UX27 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VSTM1Q6UX27 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VSTM1Q6UX27 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VSTM1Q6UX27 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VSTM1Q6UX27 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VSTM1Q6UX27 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VSTM1Q6UX27 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VSTM1Q6UX27 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VSTM1Q6UX27 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VSTM1Q6UX27 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VSTM1Q6UX27 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VSTM1Q6UX27 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VSTM1Q6UX27 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
VSTM1Q6UX27 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VSTM1Q6UX27 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VSTM1Q6UX27 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VSTM1Q6UX27 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VSTM1Q6UX27 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VSTM1Q6UX27 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VSTM1Q6UX27 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VSTM1Q6UX27 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
VSTM1Q6UX27 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VSTM1Q6UX27 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VSTM1Q6UX27 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VSTM1Q6UX27 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VSTM1Q6UX27 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VSTM1Q6UX27 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VSTM1Q6UX27 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VSTM1Q6UX27 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VSTM1Q6UX27 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VSTM1Q6UX27 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VSTM1Q6UX27 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VSTM1Q6UX27 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VSTM1Q6UX27 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VSTM1Q6UX27 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VSTM1Q6UX27 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VSTM1Q6UX27 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VSTM1Q6UX27 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
VSTM1Q6UX27 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.24
VSTM1Q6UX27 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
VSTM1Q6UX27 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VSTM1Q6UX27 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VSTM1Q6UX27 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VSTM1Q6UX27 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VSTM1Q6UX27 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VSTM1Q6UX27 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VSTM1Q6UX27 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VSTM1Q6UX27 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms