Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C16orf54Q6UWD8 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms