Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCD5

RFWD3, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFWD3Q6PCD5 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RFWD3Q6PCD5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFWD3Q6PCD5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RFWD3Q6PCD5 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFWD3Q6PCD5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFWD3Q6PCD5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFWD3Q6PCD5 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFWD3Q6PCD5 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFWD3Q6PCD5 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFWD3Q6PCD5 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFWD3Q6PCD5 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFWD3Q6PCD5 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFWD3Q6PCD5 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RFWD3Q6PCD5 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFWD3Q6PCD5 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFWD3Q6PCD5 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFWD3Q6PCD5 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFWD3Q6PCD5 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFWD3Q6PCD5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFWD3Q6PCD5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFWD3Q6PCD5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFWD3Q6PCD5 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFWD3Q6PCD5 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFWD3Q6PCD5 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFWD3Q6PCD5 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFWD3Q6PCD5 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFWD3Q6PCD5 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFWD3Q6PCD5 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RFWD3Q6PCD5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFWD3Q6PCD5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFWD3Q6PCD5 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFWD3Q6PCD5 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RFWD3Q6PCD5 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFWD3Q6PCD5 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFWD3Q6PCD5 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFWD3Q6PCD5 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFWD3Q6PCD5 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFWD3Q6PCD5 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFWD3Q6PCD5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFWD3Q6PCD5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFWD3Q6PCD5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFWD3Q6PCD5 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFWD3Q6PCD5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFWD3Q6PCD5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFWD3Q6PCD5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFWD3Q6PCD5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFWD3Q6PCD5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFWD3Q6PCD5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFWD3Q6PCD5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFWD3Q6PCD5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFWD3Q6PCD5 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFWD3Q6PCD5 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFWD3Q6PCD5 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFWD3Q6PCD5 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFWD3Q6PCD5 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFWD3Q6PCD5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFWD3Q6PCD5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFWD3Q6PCD5 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RFWD3Q6PCD5 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RFWD3Q6PCD5 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RFWD3Q6PCD5 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFWD3Q6PCD5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFWD3Q6PCD5 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFWD3Q6PCD5 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFWD3Q6PCD5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFWD3Q6PCD5 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFWD3Q6PCD5 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFWD3Q6PCD5 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFWD3Q6PCD5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFWD3Q6PCD5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFWD3Q6PCD5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFWD3Q6PCD5 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFWD3Q6PCD5 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFWD3Q6PCD5 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFWD3Q6PCD5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFWD3Q6PCD5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFWD3Q6PCD5 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFWD3Q6PCD5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFWD3Q6PCD5 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFWD3Q6PCD5 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFWD3Q6PCD5 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFWD3Q6PCD5 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFWD3Q6PCD5 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFWD3Q6PCD5 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RFWD3Q6PCD5 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFWD3Q6PCD5 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFWD3Q6PCD5 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RFWD3Q6PCD5 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFWD3Q6PCD5 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFWD3Q6PCD5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFWD3Q6PCD5 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFWD3Q6PCD5 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFWD3Q6PCD5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFWD3Q6PCD5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFWD3Q6PCD5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFWD3Q6PCD5 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFWD3Q6PCD5 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFWD3Q6PCD5 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFWD3Q6PCD5 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFWD3Q6PCD5 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms