Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXP0

EFCAB12, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB12Q6NXP0 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EFCAB12Q6NXP0 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EFCAB12Q6NXP0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EFCAB12Q6NXP0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
EFCAB12Q6NXP0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
EFCAB12Q6NXP0 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EFCAB12Q6NXP0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EFCAB12Q6NXP0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EFCAB12Q6NXP0 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EFCAB12Q6NXP0 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EFCAB12Q6NXP0 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
EFCAB12Q6NXP0 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
EFCAB12Q6NXP0 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EFCAB12Q6NXP0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EFCAB12Q6NXP0 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EFCAB12Q6NXP0 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
EFCAB12Q6NXP0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EFCAB12Q6NXP0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EFCAB12Q6NXP0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EFCAB12Q6NXP0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EFCAB12Q6NXP0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EFCAB12Q6NXP0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EFCAB12Q6NXP0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EFCAB12Q6NXP0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EFCAB12Q6NXP0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EFCAB12Q6NXP0 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EFCAB12Q6NXP0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EFCAB12Q6NXP0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EFCAB12Q6NXP0 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EFCAB12Q6NXP0 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EFCAB12Q6NXP0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EFCAB12Q6NXP0 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EFCAB12Q6NXP0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EFCAB12Q6NXP0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EFCAB12Q6NXP0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EFCAB12Q6NXP0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EFCAB12Q6NXP0 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EFCAB12Q6NXP0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EFCAB12Q6NXP0 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EFCAB12Q6NXP0 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EFCAB12Q6NXP0 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EFCAB12Q6NXP0 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EFCAB12Q6NXP0 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
EFCAB12Q6NXP0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EFCAB12Q6NXP0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EFCAB12Q6NXP0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EFCAB12Q6NXP0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EFCAB12Q6NXP0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EFCAB12Q6NXP0 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EFCAB12Q6NXP0 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EFCAB12Q6NXP0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EFCAB12Q6NXP0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EFCAB12Q6NXP0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EFCAB12Q6NXP0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EFCAB12Q6NXP0 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EFCAB12Q6NXP0 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EFCAB12Q6NXP0 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EFCAB12Q6NXP0 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EFCAB12Q6NXP0 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EFCAB12Q6NXP0 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EFCAB12Q6NXP0 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EFCAB12Q6NXP0 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EFCAB12Q6NXP0 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
EFCAB12Q6NXP0 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
EFCAB12Q6NXP0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EFCAB12Q6NXP0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EFCAB12Q6NXP0 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EFCAB12Q6NXP0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EFCAB12Q6NXP0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EFCAB12Q6NXP0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EFCAB12Q6NXP0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EFCAB12Q6NXP0 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
EFCAB12Q6NXP0 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EFCAB12Q6NXP0 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EFCAB12Q6NXP0 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EFCAB12Q6NXP0 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EFCAB12Q6NXP0 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EFCAB12Q6NXP0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EFCAB12Q6NXP0 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EFCAB12Q6NXP0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EFCAB12Q6NXP0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EFCAB12Q6NXP0 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EFCAB12Q6NXP0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EFCAB12Q6NXP0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EFCAB12Q6NXP0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EFCAB12Q6NXP0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EFCAB12Q6NXP0 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EFCAB12Q6NXP0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EFCAB12Q6NXP0 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EFCAB12Q6NXP0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EFCAB12Q6NXP0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EFCAB12Q6NXP0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EFCAB12Q6NXP0 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EFCAB12Q6NXP0 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EFCAB12Q6NXP0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EFCAB12Q6NXP0 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EFCAB12Q6NXP0 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EFCAB12Q6NXP0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EFCAB12Q6NXP0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EFCAB12Q6NXP0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms