Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NANOGP8Q6NSW7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NANOGP8Q6NSW7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NANOGP8Q6NSW7 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NANOGP8Q6NSW7 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NANOGP8Q6NSW7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NANOGP8Q6NSW7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NANOGP8Q6NSW7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NANOGP8Q6NSW7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NANOGP8Q6NSW7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NANOGP8Q6NSW7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NANOGP8Q6NSW7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NANOGP8Q6NSW7 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NANOGP8Q6NSW7 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NANOGP8Q6NSW7 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NANOGP8Q6NSW7 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NANOGP8Q6NSW7 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NANOGP8Q6NSW7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NANOGP8Q6NSW7 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NANOGP8Q6NSW7 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NANOGP8Q6NSW7 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NANOGP8Q6NSW7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NANOGP8Q6NSW7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NANOGP8Q6NSW7 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NANOGP8Q6NSW7 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NANOGP8Q6NSW7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NANOGP8Q6NSW7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NANOGP8Q6NSW7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NANOGP8Q6NSW7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NANOGP8Q6NSW7 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NANOGP8Q6NSW7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NANOGP8Q6NSW7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NANOGP8Q6NSW7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NANOGP8Q6NSW7 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NANOGP8Q6NSW7 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NANOGP8Q6NSW7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NANOGP8Q6NSW7 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NANOGP8Q6NSW7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NANOGP8Q6NSW7 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NANOGP8Q6NSW7 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NANOGP8Q6NSW7 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NANOGP8Q6NSW7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NANOGP8Q6NSW7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NANOGP8Q6NSW7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NANOGP8Q6NSW7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NANOGP8Q6NSW7 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NANOGP8Q6NSW7 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NANOGP8Q6NSW7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NANOGP8Q6NSW7 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NANOGP8Q6NSW7 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NANOGP8Q6NSW7 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NANOGP8Q6NSW7 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NANOGP8Q6NSW7 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NANOGP8Q6NSW7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NANOGP8Q6NSW7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NANOGP8Q6NSW7 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NANOGP8Q6NSW7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
NANOGP8Q6NSW7 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NANOGP8Q6NSW7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NANOGP8Q6NSW7 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NANOGP8Q6NSW7 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NANOGP8Q6NSW7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NANOGP8Q6NSW7 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NANOGP8Q6NSW7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NANOGP8Q6NSW7 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NANOGP8Q6NSW7 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NANOGP8Q6NSW7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NANOGP8Q6NSW7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NANOGP8Q6NSW7 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NANOGP8Q6NSW7 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NANOGP8Q6NSW7 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NANOGP8Q6NSW7 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NANOGP8Q6NSW7 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NANOGP8Q6NSW7 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NANOGP8Q6NSW7 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NANOGP8Q6NSW7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NANOGP8Q6NSW7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NANOGP8Q6NSW7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
NANOGP8Q6NSW7 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
NANOGP8Q6NSW7 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NANOGP8Q6NSW7 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NANOGP8Q6NSW7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NANOGP8Q6NSW7 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NANOGP8Q6NSW7 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NANOGP8Q6NSW7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NANOGP8Q6NSW7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NANOGP8Q6NSW7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NANOGP8Q6NSW7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NANOGP8Q6NSW7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NANOGP8Q6NSW7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NANOGP8Q6NSW7 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NANOGP8Q6NSW7 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NANOGP8Q6NSW7 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NANOGP8Q6NSW7 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NANOGP8Q6NSW7 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NANOGP8Q6NSW7 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NANOGP8Q6NSW7 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NANOGP8Q6NSW7 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NANOGP8Q6NSW7 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NANOGP8Q6NSW7 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms