Protein–RNA interactions for Protein: Q6GMV2

SMYD5, SET and MYND domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD5Q6GMV2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMYD5Q6GMV2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMYD5Q6GMV2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMYD5Q6GMV2 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMYD5Q6GMV2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMYD5Q6GMV2 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMYD5Q6GMV2 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMYD5Q6GMV2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMYD5Q6GMV2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMYD5Q6GMV2 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMYD5Q6GMV2 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMYD5Q6GMV2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMYD5Q6GMV2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMYD5Q6GMV2 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMYD5Q6GMV2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMYD5Q6GMV2 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SMYD5Q6GMV2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMYD5Q6GMV2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMYD5Q6GMV2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMYD5Q6GMV2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMYD5Q6GMV2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMYD5Q6GMV2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SMYD5Q6GMV2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMYD5Q6GMV2 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMYD5Q6GMV2 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMYD5Q6GMV2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMYD5Q6GMV2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMYD5Q6GMV2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMYD5Q6GMV2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMYD5Q6GMV2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMYD5Q6GMV2 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMYD5Q6GMV2 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMYD5Q6GMV2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SMYD5Q6GMV2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SMYD5Q6GMV2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMYD5Q6GMV2 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMYD5Q6GMV2 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMYD5Q6GMV2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMYD5Q6GMV2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SMYD5Q6GMV2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMYD5Q6GMV2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMYD5Q6GMV2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMYD5Q6GMV2 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMYD5Q6GMV2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMYD5Q6GMV2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMYD5Q6GMV2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMYD5Q6GMV2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMYD5Q6GMV2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMYD5Q6GMV2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMYD5Q6GMV2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMYD5Q6GMV2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMYD5Q6GMV2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMYD5Q6GMV2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMYD5Q6GMV2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMYD5Q6GMV2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMYD5Q6GMV2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMYD5Q6GMV2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMYD5Q6GMV2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMYD5Q6GMV2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMYD5Q6GMV2 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMYD5Q6GMV2 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMYD5Q6GMV2 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMYD5Q6GMV2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMYD5Q6GMV2 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMYD5Q6GMV2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SMYD5Q6GMV2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SMYD5Q6GMV2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMYD5Q6GMV2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMYD5Q6GMV2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMYD5Q6GMV2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMYD5Q6GMV2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMYD5Q6GMV2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMYD5Q6GMV2 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMYD5Q6GMV2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMYD5Q6GMV2 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMYD5Q6GMV2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMYD5Q6GMV2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMYD5Q6GMV2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMYD5Q6GMV2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMYD5Q6GMV2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMYD5Q6GMV2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMYD5Q6GMV2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMYD5Q6GMV2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMYD5Q6GMV2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMYD5Q6GMV2 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMYD5Q6GMV2 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMYD5Q6GMV2 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMYD5Q6GMV2 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMYD5Q6GMV2 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMYD5Q6GMV2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SMYD5Q6GMV2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMYD5Q6GMV2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMYD5Q6GMV2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMYD5Q6GMV2 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMYD5Q6GMV2 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMYD5Q6GMV2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMYD5Q6GMV2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMYD5Q6GMV2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMYD5Q6GMV2 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMYD5Q6GMV2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms