Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU3

CHIC1, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC1Q5VXU3 HSFY1P1-201ENST00000423928 1178 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
CHIC1Q5VXU3 MGA-212ENST00000619521 1496 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
CHIC1Q5VXU3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
CHIC1Q5VXU3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC36.7■■■■□ 3.47
CHIC1Q5VXU3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC36.7■■■■□ 3.47
CHIC1Q5VXU3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
CHIC1Q5VXU3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC36.7■■■■□ 3.47
CHIC1Q5VXU3 AC005972.3-201ENST00000606304 481 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
CHIC1Q5VXU3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
CHIC1Q5VXU3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
CHIC1Q5VXU3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
CHIC1Q5VXU3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.46
CHIC1Q5VXU3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
CHIC1Q5VXU3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
CHIC1Q5VXU3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
CHIC1Q5VXU3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
CHIC1Q5VXU3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
CHIC1Q5VXU3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
CHIC1Q5VXU3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
CHIC1Q5VXU3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
CHIC1Q5VXU3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC36.68■■■■□ 3.46
CHIC1Q5VXU3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
CHIC1Q5VXU3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
CHIC1Q5VXU3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
CHIC1Q5VXU3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
CHIC1Q5VXU3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
CHIC1Q5VXU3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
CHIC1Q5VXU3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
CHIC1Q5VXU3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
CHIC1Q5VXU3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
CHIC1Q5VXU3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
CHIC1Q5VXU3 ELOCP6-201ENST00000429066 328 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
CHIC1Q5VXU3 ELOCP12-201ENST00000458706 328 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
CHIC1Q5VXU3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
CHIC1Q5VXU3 AC027281.2-201ENST00000623856 713 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
CHIC1Q5VXU3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
CHIC1Q5VXU3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC36.67■■■■□ 3.46
CHIC1Q5VXU3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
CHIC1Q5VXU3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
CHIC1Q5VXU3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
CHIC1Q5VXU3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
CHIC1Q5VXU3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
CHIC1Q5VXU3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
CHIC1Q5VXU3 IMMP2L-204ENST00000447215 1164 ntTSL 3 BASIC36.66■■■■□ 3.46
CHIC1Q5VXU3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
CHIC1Q5VXU3 AL079304.1-201ENST00000554595 828 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
CHIC1Q5VXU3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
CHIC1Q5VXU3 CBR3-AS1-213ENST00000623647 815 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
CHIC1Q5VXU3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
CHIC1Q5VXU3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
CHIC1Q5VXU3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
CHIC1Q5VXU3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
CHIC1Q5VXU3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
CHIC1Q5VXU3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
CHIC1Q5VXU3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
CHIC1Q5VXU3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
CHIC1Q5VXU3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
CHIC1Q5VXU3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
CHIC1Q5VXU3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
CHIC1Q5VXU3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
CHIC1Q5VXU3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
CHIC1Q5VXU3 SMIM11B-202ENST00000619874 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
CHIC1Q5VXU3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
CHIC1Q5VXU3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
CHIC1Q5VXU3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
CHIC1Q5VXU3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
CHIC1Q5VXU3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
CHIC1Q5VXU3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
CHIC1Q5VXU3 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
CHIC1Q5VXU3 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
CHIC1Q5VXU3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
CHIC1Q5VXU3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
CHIC1Q5VXU3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
CHIC1Q5VXU3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
CHIC1Q5VXU3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
CHIC1Q5VXU3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
CHIC1Q5VXU3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
CHIC1Q5VXU3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
CHIC1Q5VXU3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
CHIC1Q5VXU3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
CHIC1Q5VXU3 SPATA4-201ENST00000280191 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
CHIC1Q5VXU3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
CHIC1Q5VXU3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC36.63■■■■□ 3.45
CHIC1Q5VXU3 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
CHIC1Q5VXU3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
CHIC1Q5VXU3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
CHIC1Q5VXU3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
CHIC1Q5VXU3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
CHIC1Q5VXU3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
CHIC1Q5VXU3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
CHIC1Q5VXU3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
CHIC1Q5VXU3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
CHIC1Q5VXU3 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
CHIC1Q5VXU3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
CHIC1Q5VXU3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
CHIC1Q5VXU3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
CHIC1Q5VXU3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
CHIC1Q5VXU3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
CHIC1Q5VXU3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
CHIC1Q5VXU3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC36.61■■■■□ 3.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms