Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWM3

PRAMEF18, PRAME family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF18Q5VWM3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRAMEF18Q5VWM3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRAMEF18Q5VWM3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PRAMEF18Q5VWM3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRAMEF18Q5VWM3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRAMEF18Q5VWM3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRAMEF18Q5VWM3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRAMEF18Q5VWM3 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRAMEF18Q5VWM3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRAMEF18Q5VWM3 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRAMEF18Q5VWM3 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRAMEF18Q5VWM3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRAMEF18Q5VWM3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRAMEF18Q5VWM3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRAMEF18Q5VWM3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRAMEF18Q5VWM3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRAMEF18Q5VWM3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRAMEF18Q5VWM3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRAMEF18Q5VWM3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRAMEF18Q5VWM3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRAMEF18Q5VWM3 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRAMEF18Q5VWM3 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRAMEF18Q5VWM3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRAMEF18Q5VWM3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRAMEF18Q5VWM3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRAMEF18Q5VWM3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRAMEF18Q5VWM3 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRAMEF18Q5VWM3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PRAMEF18Q5VWM3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRAMEF18Q5VWM3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRAMEF18Q5VWM3 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRAMEF18Q5VWM3 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRAMEF18Q5VWM3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PRAMEF18Q5VWM3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRAMEF18Q5VWM3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRAMEF18Q5VWM3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRAMEF18Q5VWM3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRAMEF18Q5VWM3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRAMEF18Q5VWM3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRAMEF18Q5VWM3 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRAMEF18Q5VWM3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRAMEF18Q5VWM3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PRAMEF18Q5VWM3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRAMEF18Q5VWM3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PRAMEF18Q5VWM3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRAMEF18Q5VWM3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRAMEF18Q5VWM3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRAMEF18Q5VWM3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRAMEF18Q5VWM3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRAMEF18Q5VWM3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRAMEF18Q5VWM3 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRAMEF18Q5VWM3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRAMEF18Q5VWM3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRAMEF18Q5VWM3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRAMEF18Q5VWM3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRAMEF18Q5VWM3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRAMEF18Q5VWM3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRAMEF18Q5VWM3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRAMEF18Q5VWM3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRAMEF18Q5VWM3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRAMEF18Q5VWM3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRAMEF18Q5VWM3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRAMEF18Q5VWM3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRAMEF18Q5VWM3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PRAMEF18Q5VWM3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRAMEF18Q5VWM3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PRAMEF18Q5VWM3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRAMEF18Q5VWM3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRAMEF18Q5VWM3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRAMEF18Q5VWM3 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRAMEF18Q5VWM3 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRAMEF18Q5VWM3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRAMEF18Q5VWM3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRAMEF18Q5VWM3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRAMEF18Q5VWM3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRAMEF18Q5VWM3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRAMEF18Q5VWM3 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PRAMEF18Q5VWM3 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRAMEF18Q5VWM3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRAMEF18Q5VWM3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRAMEF18Q5VWM3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRAMEF18Q5VWM3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRAMEF18Q5VWM3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRAMEF18Q5VWM3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRAMEF18Q5VWM3 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRAMEF18Q5VWM3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRAMEF18Q5VWM3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRAMEF18Q5VWM3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRAMEF18Q5VWM3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRAMEF18Q5VWM3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRAMEF18Q5VWM3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRAMEF18Q5VWM3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRAMEF18Q5VWM3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRAMEF18Q5VWM3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRAMEF18Q5VWM3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRAMEF18Q5VWM3 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PRAMEF18Q5VWM3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRAMEF18Q5VWM3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRAMEF18Q5VWM3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRAMEF18Q5VWM3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms