Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
RIF1Q5UIP0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RIF1Q5UIP0 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RIF1Q5UIP0 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RIF1Q5UIP0 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
RIF1Q5UIP0 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RIF1Q5UIP0 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RIF1Q5UIP0 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RIF1Q5UIP0 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RIF1Q5UIP0 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RIF1Q5UIP0 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RIF1Q5UIP0 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
RIF1Q5UIP0 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RIF1Q5UIP0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RIF1Q5UIP0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RIF1Q5UIP0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RIF1Q5UIP0 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RIF1Q5UIP0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RIF1Q5UIP0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RIF1Q5UIP0 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
RIF1Q5UIP0 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RIF1Q5UIP0 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RIF1Q5UIP0 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
RIF1Q5UIP0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RIF1Q5UIP0 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RIF1Q5UIP0 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RIF1Q5UIP0 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RIF1Q5UIP0 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RIF1Q5UIP0 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RIF1Q5UIP0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RIF1Q5UIP0 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RIF1Q5UIP0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RIF1Q5UIP0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RIF1Q5UIP0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
RIF1Q5UIP0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RIF1Q5UIP0 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RIF1Q5UIP0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RIF1Q5UIP0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RIF1Q5UIP0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RIF1Q5UIP0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RIF1Q5UIP0 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RIF1Q5UIP0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RIF1Q5UIP0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RIF1Q5UIP0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RIF1Q5UIP0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RIF1Q5UIP0 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RIF1Q5UIP0 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RIF1Q5UIP0 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RIF1Q5UIP0 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RIF1Q5UIP0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RIF1Q5UIP0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RIF1Q5UIP0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RIF1Q5UIP0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RIF1Q5UIP0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RIF1Q5UIP0 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RIF1Q5UIP0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RIF1Q5UIP0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RIF1Q5UIP0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RIF1Q5UIP0 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RIF1Q5UIP0 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RIF1Q5UIP0 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RIF1Q5UIP0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RIF1Q5UIP0 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RIF1Q5UIP0 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RIF1Q5UIP0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RIF1Q5UIP0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RIF1Q5UIP0 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RIF1Q5UIP0 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RIF1Q5UIP0 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RIF1Q5UIP0 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RIF1Q5UIP0 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RIF1Q5UIP0 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RIF1Q5UIP0 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RIF1Q5UIP0 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RIF1Q5UIP0 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RIF1Q5UIP0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RIF1Q5UIP0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RIF1Q5UIP0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RIF1Q5UIP0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RIF1Q5UIP0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RIF1Q5UIP0 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RIF1Q5UIP0 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RIF1Q5UIP0 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RIF1Q5UIP0 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RIF1Q5UIP0 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RIF1Q5UIP0 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RIF1Q5UIP0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RIF1Q5UIP0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RIF1Q5UIP0 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RIF1Q5UIP0 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RIF1Q5UIP0 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RIF1Q5UIP0 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RIF1Q5UIP0 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RIF1Q5UIP0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RIF1Q5UIP0 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RIF1Q5UIP0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RIF1Q5UIP0 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RIF1Q5UIP0 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RIF1Q5UIP0 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RIF1Q5UIP0 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms