Protein–RNA interactions for Protein: Q5TYX0

PRAMEF5, PRAME family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF5Q5TYX0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRAMEF5Q5TYX0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRAMEF5Q5TYX0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRAMEF5Q5TYX0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRAMEF5Q5TYX0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRAMEF5Q5TYX0 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRAMEF5Q5TYX0 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRAMEF5Q5TYX0 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRAMEF5Q5TYX0 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRAMEF5Q5TYX0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PRAMEF5Q5TYX0 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRAMEF5Q5TYX0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRAMEF5Q5TYX0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRAMEF5Q5TYX0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRAMEF5Q5TYX0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRAMEF5Q5TYX0 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRAMEF5Q5TYX0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms