Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2N8

ATAD3C, ATPase family AAA domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3CQ5T2N8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATAD3CQ5T2N8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATAD3CQ5T2N8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATAD3CQ5T2N8 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATAD3CQ5T2N8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATAD3CQ5T2N8 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATAD3CQ5T2N8 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATAD3CQ5T2N8 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATAD3CQ5T2N8 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATAD3CQ5T2N8 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATAD3CQ5T2N8 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATAD3CQ5T2N8 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATAD3CQ5T2N8 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATAD3CQ5T2N8 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATAD3CQ5T2N8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATAD3CQ5T2N8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATAD3CQ5T2N8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATAD3CQ5T2N8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ATAD3CQ5T2N8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ATAD3CQ5T2N8 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATAD3CQ5T2N8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATAD3CQ5T2N8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATAD3CQ5T2N8 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATAD3CQ5T2N8 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATAD3CQ5T2N8 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATAD3CQ5T2N8 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATAD3CQ5T2N8 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ATAD3CQ5T2N8 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATAD3CQ5T2N8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATAD3CQ5T2N8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATAD3CQ5T2N8 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATAD3CQ5T2N8 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATAD3CQ5T2N8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATAD3CQ5T2N8 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATAD3CQ5T2N8 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATAD3CQ5T2N8 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATAD3CQ5T2N8 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATAD3CQ5T2N8 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATAD3CQ5T2N8 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATAD3CQ5T2N8 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATAD3CQ5T2N8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATAD3CQ5T2N8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATAD3CQ5T2N8 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATAD3CQ5T2N8 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATAD3CQ5T2N8 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATAD3CQ5T2N8 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATAD3CQ5T2N8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATAD3CQ5T2N8 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATAD3CQ5T2N8 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATAD3CQ5T2N8 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATAD3CQ5T2N8 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATAD3CQ5T2N8 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATAD3CQ5T2N8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATAD3CQ5T2N8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATAD3CQ5T2N8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATAD3CQ5T2N8 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATAD3CQ5T2N8 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATAD3CQ5T2N8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATAD3CQ5T2N8 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATAD3CQ5T2N8 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATAD3CQ5T2N8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATAD3CQ5T2N8 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATAD3CQ5T2N8 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATAD3CQ5T2N8 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATAD3CQ5T2N8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATAD3CQ5T2N8 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATAD3CQ5T2N8 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATAD3CQ5T2N8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATAD3CQ5T2N8 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATAD3CQ5T2N8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATAD3CQ5T2N8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATAD3CQ5T2N8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATAD3CQ5T2N8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATAD3CQ5T2N8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ATAD3CQ5T2N8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATAD3CQ5T2N8 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATAD3CQ5T2N8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATAD3CQ5T2N8 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATAD3CQ5T2N8 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATAD3CQ5T2N8 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATAD3CQ5T2N8 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATAD3CQ5T2N8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATAD3CQ5T2N8 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATAD3CQ5T2N8 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATAD3CQ5T2N8 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATAD3CQ5T2N8 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATAD3CQ5T2N8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATAD3CQ5T2N8 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ATAD3CQ5T2N8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATAD3CQ5T2N8 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATAD3CQ5T2N8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATAD3CQ5T2N8 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATAD3CQ5T2N8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATAD3CQ5T2N8 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATAD3CQ5T2N8 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATAD3CQ5T2N8 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATAD3CQ5T2N8 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATAD3CQ5T2N8 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATAD3CQ5T2N8 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATAD3CQ5T2N8 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms