Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NUP188Q5SRE5 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
NUP188Q5SRE5 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NUP188Q5SRE5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NUP188Q5SRE5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NUP188Q5SRE5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NUP188Q5SRE5 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NUP188Q5SRE5 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NUP188Q5SRE5 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NUP188Q5SRE5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NUP188Q5SRE5 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NUP188Q5SRE5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NUP188Q5SRE5 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NUP188Q5SRE5 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
NUP188Q5SRE5 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NUP188Q5SRE5 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
NUP188Q5SRE5 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NUP188Q5SRE5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NUP188Q5SRE5 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NUP188Q5SRE5 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NUP188Q5SRE5 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NUP188Q5SRE5 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NUP188Q5SRE5 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
NUP188Q5SRE5 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NUP188Q5SRE5 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NUP188Q5SRE5 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
NUP188Q5SRE5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NUP188Q5SRE5 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NUP188Q5SRE5 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NUP188Q5SRE5 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
NUP188Q5SRE5 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NUP188Q5SRE5 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NUP188Q5SRE5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NUP188Q5SRE5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NUP188Q5SRE5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NUP188Q5SRE5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NUP188Q5SRE5 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NUP188Q5SRE5 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NUP188Q5SRE5 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NUP188Q5SRE5 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NUP188Q5SRE5 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NUP188Q5SRE5 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
NUP188Q5SRE5 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NUP188Q5SRE5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NUP188Q5SRE5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NUP188Q5SRE5 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NUP188Q5SRE5 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NUP188Q5SRE5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NUP188Q5SRE5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NUP188Q5SRE5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NUP188Q5SRE5 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NUP188Q5SRE5 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NUP188Q5SRE5 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NUP188Q5SRE5 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NUP188Q5SRE5 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NUP188Q5SRE5 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NUP188Q5SRE5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NUP188Q5SRE5 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NUP188Q5SRE5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NUP188Q5SRE5 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NUP188Q5SRE5 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NUP188Q5SRE5 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NUP188Q5SRE5 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NUP188Q5SRE5 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NUP188Q5SRE5 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NUP188Q5SRE5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NUP188Q5SRE5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NUP188Q5SRE5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NUP188Q5SRE5 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NUP188Q5SRE5 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NUP188Q5SRE5 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NUP188Q5SRE5 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NUP188Q5SRE5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NUP188Q5SRE5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NUP188Q5SRE5 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
NUP188Q5SRE5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NUP188Q5SRE5 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
NUP188Q5SRE5 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NUP188Q5SRE5 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
NUP188Q5SRE5 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NUP188Q5SRE5 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
NUP188Q5SRE5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NUP188Q5SRE5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NUP188Q5SRE5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NUP188Q5SRE5 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NUP188Q5SRE5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NUP188Q5SRE5 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC28■■■□□ 2.07
NUP188Q5SRE5 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC28■■■□□ 2.07
NUP188Q5SRE5 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
NUP188Q5SRE5 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NUP188Q5SRE5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NUP188Q5SRE5 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NUP188Q5SRE5 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
NUP188Q5SRE5 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
NUP188Q5SRE5 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NUP188Q5SRE5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NUP188Q5SRE5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NUP188Q5SRE5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NUP188Q5SRE5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NUP188Q5SRE5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms