Protein–RNA interactions for Protein: Q5PRF9

SAMD4B, Protein Smaug homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4BQ5PRF9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SAMD4BQ5PRF9 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SAMD4BQ5PRF9 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SAMD4BQ5PRF9 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SAMD4BQ5PRF9 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SAMD4BQ5PRF9 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SAMD4BQ5PRF9 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SAMD4BQ5PRF9 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SAMD4BQ5PRF9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SAMD4BQ5PRF9 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SAMD4BQ5PRF9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SAMD4BQ5PRF9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SAMD4BQ5PRF9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SAMD4BQ5PRF9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SAMD4BQ5PRF9 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SAMD4BQ5PRF9 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SAMD4BQ5PRF9 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SAMD4BQ5PRF9 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SAMD4BQ5PRF9 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SAMD4BQ5PRF9 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SAMD4BQ5PRF9 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SAMD4BQ5PRF9 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SAMD4BQ5PRF9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SAMD4BQ5PRF9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SAMD4BQ5PRF9 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SAMD4BQ5PRF9 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SAMD4BQ5PRF9 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SAMD4BQ5PRF9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SAMD4BQ5PRF9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SAMD4BQ5PRF9 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SAMD4BQ5PRF9 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SAMD4BQ5PRF9 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SAMD4BQ5PRF9 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SAMD4BQ5PRF9 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SAMD4BQ5PRF9 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SAMD4BQ5PRF9 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SAMD4BQ5PRF9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SAMD4BQ5PRF9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SAMD4BQ5PRF9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SAMD4BQ5PRF9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SAMD4BQ5PRF9 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SAMD4BQ5PRF9 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SAMD4BQ5PRF9 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SAMD4BQ5PRF9 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SAMD4BQ5PRF9 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SAMD4BQ5PRF9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SAMD4BQ5PRF9 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SAMD4BQ5PRF9 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SAMD4BQ5PRF9 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SAMD4BQ5PRF9 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SAMD4BQ5PRF9 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SAMD4BQ5PRF9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SAMD4BQ5PRF9 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SAMD4BQ5PRF9 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SAMD4BQ5PRF9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SAMD4BQ5PRF9 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SAMD4BQ5PRF9 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SAMD4BQ5PRF9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SAMD4BQ5PRF9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SAMD4BQ5PRF9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SAMD4BQ5PRF9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SAMD4BQ5PRF9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SAMD4BQ5PRF9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SAMD4BQ5PRF9 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SAMD4BQ5PRF9 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SAMD4BQ5PRF9 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SAMD4BQ5PRF9 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SAMD4BQ5PRF9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SAMD4BQ5PRF9 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SAMD4BQ5PRF9 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SAMD4BQ5PRF9 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SAMD4BQ5PRF9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SAMD4BQ5PRF9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SAMD4BQ5PRF9 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SAMD4BQ5PRF9 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SAMD4BQ5PRF9 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SAMD4BQ5PRF9 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SAMD4BQ5PRF9 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SAMD4BQ5PRF9 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SAMD4BQ5PRF9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SAMD4BQ5PRF9 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SAMD4BQ5PRF9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SAMD4BQ5PRF9 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SAMD4BQ5PRF9 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SAMD4BQ5PRF9 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SAMD4BQ5PRF9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SAMD4BQ5PRF9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SAMD4BQ5PRF9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SAMD4BQ5PRF9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SAMD4BQ5PRF9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SAMD4BQ5PRF9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SAMD4BQ5PRF9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SAMD4BQ5PRF9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SAMD4BQ5PRF9 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SAMD4BQ5PRF9 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SAMD4BQ5PRF9 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SAMD4BQ5PRF9 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SAMD4BQ5PRF9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SAMD4BQ5PRF9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SAMD4BQ5PRF9 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms