Protein–RNA interactions for Protein: Q5JT25

RAB41, Ras-related protein Rab-41, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB41Q5JT25 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB41Q5JT25 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB41Q5JT25 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB41Q5JT25 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB41Q5JT25 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB41Q5JT25 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB41Q5JT25 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB41Q5JT25 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB41Q5JT25 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB41Q5JT25 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB41Q5JT25 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB41Q5JT25 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB41Q5JT25 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB41Q5JT25 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB41Q5JT25 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
RAB41Q5JT25 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB41Q5JT25 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB41Q5JT25 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB41Q5JT25 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB41Q5JT25 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB41Q5JT25 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB41Q5JT25 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB41Q5JT25 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB41Q5JT25 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB41Q5JT25 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB41Q5JT25 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB41Q5JT25 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB41Q5JT25 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB41Q5JT25 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB41Q5JT25 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB41Q5JT25 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB41Q5JT25 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB41Q5JT25 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB41Q5JT25 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB41Q5JT25 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB41Q5JT25 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB41Q5JT25 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB41Q5JT25 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB41Q5JT25 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB41Q5JT25 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB41Q5JT25 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB41Q5JT25 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB41Q5JT25 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB41Q5JT25 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB41Q5JT25 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB41Q5JT25 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB41Q5JT25 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB41Q5JT25 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB41Q5JT25 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB41Q5JT25 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB41Q5JT25 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB41Q5JT25 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB41Q5JT25 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB41Q5JT25 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB41Q5JT25 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB41Q5JT25 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB41Q5JT25 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB41Q5JT25 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB41Q5JT25 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB41Q5JT25 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB41Q5JT25 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB41Q5JT25 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB41Q5JT25 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB41Q5JT25 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB41Q5JT25 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB41Q5JT25 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB41Q5JT25 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB41Q5JT25 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB41Q5JT25 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB41Q5JT25 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB41Q5JT25 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB41Q5JT25 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB41Q5JT25 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB41Q5JT25 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB41Q5JT25 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB41Q5JT25 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB41Q5JT25 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB41Q5JT25 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB41Q5JT25 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB41Q5JT25 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB41Q5JT25 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB41Q5JT25 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB41Q5JT25 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB41Q5JT25 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB41Q5JT25 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB41Q5JT25 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB41Q5JT25 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB41Q5JT25 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB41Q5JT25 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB41Q5JT25 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB41Q5JT25 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB41Q5JT25 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB41Q5JT25 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB41Q5JT25 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB41Q5JT25 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB41Q5JT25 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB41Q5JT25 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB41Q5JT25 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB41Q5JT25 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB41Q5JT25 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms