Protein–RNA interactions for Protein: Q5JS37

NHLRC3, NHL repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC3Q5JS37 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NHLRC3Q5JS37 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NHLRC3Q5JS37 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NHLRC3Q5JS37 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NHLRC3Q5JS37 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NHLRC3Q5JS37 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NHLRC3Q5JS37 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NHLRC3Q5JS37 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NHLRC3Q5JS37 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NHLRC3Q5JS37 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NHLRC3Q5JS37 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NHLRC3Q5JS37 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NHLRC3Q5JS37 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NHLRC3Q5JS37 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NHLRC3Q5JS37 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NHLRC3Q5JS37 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NHLRC3Q5JS37 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NHLRC3Q5JS37 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NHLRC3Q5JS37 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NHLRC3Q5JS37 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NHLRC3Q5JS37 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NHLRC3Q5JS37 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NHLRC3Q5JS37 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NHLRC3Q5JS37 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NHLRC3Q5JS37 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NHLRC3Q5JS37 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NHLRC3Q5JS37 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NHLRC3Q5JS37 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NHLRC3Q5JS37 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NHLRC3Q5JS37 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NHLRC3Q5JS37 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NHLRC3Q5JS37 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NHLRC3Q5JS37 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NHLRC3Q5JS37 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NHLRC3Q5JS37 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NHLRC3Q5JS37 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NHLRC3Q5JS37 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NHLRC3Q5JS37 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NHLRC3Q5JS37 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
NHLRC3Q5JS37 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NHLRC3Q5JS37 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NHLRC3Q5JS37 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NHLRC3Q5JS37 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NHLRC3Q5JS37 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NHLRC3Q5JS37 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NHLRC3Q5JS37 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NHLRC3Q5JS37 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NHLRC3Q5JS37 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NHLRC3Q5JS37 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NHLRC3Q5JS37 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NHLRC3Q5JS37 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NHLRC3Q5JS37 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NHLRC3Q5JS37 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NHLRC3Q5JS37 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NHLRC3Q5JS37 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NHLRC3Q5JS37 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NHLRC3Q5JS37 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NHLRC3Q5JS37 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NHLRC3Q5JS37 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NHLRC3Q5JS37 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NHLRC3Q5JS37 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NHLRC3Q5JS37 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NHLRC3Q5JS37 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NHLRC3Q5JS37 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NHLRC3Q5JS37 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NHLRC3Q5JS37 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NHLRC3Q5JS37 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NHLRC3Q5JS37 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NHLRC3Q5JS37 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NHLRC3Q5JS37 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NHLRC3Q5JS37 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NHLRC3Q5JS37 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NHLRC3Q5JS37 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NHLRC3Q5JS37 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NHLRC3Q5JS37 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NHLRC3Q5JS37 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NHLRC3Q5JS37 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NHLRC3Q5JS37 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NHLRC3Q5JS37 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NHLRC3Q5JS37 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NHLRC3Q5JS37 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NHLRC3Q5JS37 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NHLRC3Q5JS37 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NHLRC3Q5JS37 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NHLRC3Q5JS37 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NHLRC3Q5JS37 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NHLRC3Q5JS37 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NHLRC3Q5JS37 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NHLRC3Q5JS37 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NHLRC3Q5JS37 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NHLRC3Q5JS37 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NHLRC3Q5JS37 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NHLRC3Q5JS37 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NHLRC3Q5JS37 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NHLRC3Q5JS37 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NHLRC3Q5JS37 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NHLRC3Q5JS37 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NHLRC3Q5JS37 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NHLRC3Q5JS37 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NHLRC3Q5JS37 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms