Protein–RNA interactions for Protein: Q5JR12

PPM1J, Protein phosphatase 1J, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPM1JQ5JR12 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPM1JQ5JR12 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPM1JQ5JR12 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPM1JQ5JR12 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPM1JQ5JR12 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPM1JQ5JR12 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPM1JQ5JR12 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPM1JQ5JR12 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPM1JQ5JR12 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPM1JQ5JR12 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PPM1JQ5JR12 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPM1JQ5JR12 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPM1JQ5JR12 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPM1JQ5JR12 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPM1JQ5JR12 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PPM1JQ5JR12 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPM1JQ5JR12 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPM1JQ5JR12 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPM1JQ5JR12 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPM1JQ5JR12 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPM1JQ5JR12 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPM1JQ5JR12 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPM1JQ5JR12 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPM1JQ5JR12 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPM1JQ5JR12 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPM1JQ5JR12 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PPM1JQ5JR12 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPM1JQ5JR12 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPM1JQ5JR12 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPM1JQ5JR12 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPM1JQ5JR12 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PPM1JQ5JR12 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPM1JQ5JR12 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPM1JQ5JR12 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPM1JQ5JR12 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPM1JQ5JR12 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPM1JQ5JR12 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPM1JQ5JR12 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPM1JQ5JR12 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPM1JQ5JR12 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPM1JQ5JR12 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPM1JQ5JR12 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPM1JQ5JR12 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPM1JQ5JR12 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPM1JQ5JR12 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPM1JQ5JR12 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPM1JQ5JR12 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PPM1JQ5JR12 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PPM1JQ5JR12 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPM1JQ5JR12 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPM1JQ5JR12 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPM1JQ5JR12 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPM1JQ5JR12 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPM1JQ5JR12 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPM1JQ5JR12 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPM1JQ5JR12 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPM1JQ5JR12 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPM1JQ5JR12 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPM1JQ5JR12 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPM1JQ5JR12 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PPM1JQ5JR12 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPM1JQ5JR12 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPM1JQ5JR12 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPM1JQ5JR12 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPM1JQ5JR12 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPM1JQ5JR12 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PPM1JQ5JR12 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PPM1JQ5JR12 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PPM1JQ5JR12 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPM1JQ5JR12 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPM1JQ5JR12 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPM1JQ5JR12 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPM1JQ5JR12 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPM1JQ5JR12 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPM1JQ5JR12 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPM1JQ5JR12 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPM1JQ5JR12 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPM1JQ5JR12 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPM1JQ5JR12 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPM1JQ5JR12 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPM1JQ5JR12 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PPM1JQ5JR12 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PPM1JQ5JR12 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PPM1JQ5JR12 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPM1JQ5JR12 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPM1JQ5JR12 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPM1JQ5JR12 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PPM1JQ5JR12 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPM1JQ5JR12 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPM1JQ5JR12 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPM1JQ5JR12 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PPM1JQ5JR12 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PPM1JQ5JR12 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PPM1JQ5JR12 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPM1JQ5JR12 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PPM1JQ5JR12 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PPM1JQ5JR12 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PPM1JQ5JR12 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PPM1JQ5JR12 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPM1JQ5JR12 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms