Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPL39P5Q59GN2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPL39P5Q59GN2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPL39P5Q59GN2 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPL39P5Q59GN2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPL39P5Q59GN2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPL39P5Q59GN2 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPL39P5Q59GN2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPL39P5Q59GN2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RPL39P5Q59GN2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPL39P5Q59GN2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPL39P5Q59GN2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPL39P5Q59GN2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPL39P5Q59GN2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPL39P5Q59GN2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPL39P5Q59GN2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPL39P5Q59GN2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPL39P5Q59GN2 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPL39P5Q59GN2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RPL39P5Q59GN2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPL39P5Q59GN2 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPL39P5Q59GN2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
RPL39P5Q59GN2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPL39P5Q59GN2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPL39P5Q59GN2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPL39P5Q59GN2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPL39P5Q59GN2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPL39P5Q59GN2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPL39P5Q59GN2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
RPL39P5Q59GN2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPL39P5Q59GN2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPL39P5Q59GN2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPL39P5Q59GN2 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPL39P5Q59GN2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPL39P5Q59GN2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPL39P5Q59GN2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPL39P5Q59GN2 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPL39P5Q59GN2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPL39P5Q59GN2 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPL39P5Q59GN2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPL39P5Q59GN2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPL39P5Q59GN2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPL39P5Q59GN2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPL39P5Q59GN2 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPL39P5Q59GN2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPL39P5Q59GN2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPL39P5Q59GN2 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPL39P5Q59GN2 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPL39P5Q59GN2 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPL39P5Q59GN2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPL39P5Q59GN2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPL39P5Q59GN2 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
RPL39P5Q59GN2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPL39P5Q59GN2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPL39P5Q59GN2 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPL39P5Q59GN2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPL39P5Q59GN2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPL39P5Q59GN2 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPL39P5Q59GN2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPL39P5Q59GN2 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPL39P5Q59GN2 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPL39P5Q59GN2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPL39P5Q59GN2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPL39P5Q59GN2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPL39P5Q59GN2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPL39P5Q59GN2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPL39P5Q59GN2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RPL39P5Q59GN2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPL39P5Q59GN2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPL39P5Q59GN2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPL39P5Q59GN2 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPL39P5Q59GN2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPL39P5Q59GN2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPL39P5Q59GN2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPL39P5Q59GN2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPL39P5Q59GN2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPL39P5Q59GN2 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPL39P5Q59GN2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPL39P5Q59GN2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPL39P5Q59GN2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPL39P5Q59GN2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPL39P5Q59GN2 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPL39P5Q59GN2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RPL39P5Q59GN2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPL39P5Q59GN2 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RPL39P5Q59GN2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RPL39P5Q59GN2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPL39P5Q59GN2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPL39P5Q59GN2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPL39P5Q59GN2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPL39P5Q59GN2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPL39P5Q59GN2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPL39P5Q59GN2 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPL39P5Q59GN2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPL39P5Q59GN2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPL39P5Q59GN2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPL39P5Q59GN2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPL39P5Q59GN2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPL39P5Q59GN2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPL39P5Q59GN2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms