Protein–RNA interactions for Protein: Q58FF7

HSP90AB3P, Putative heat shock protein HSP 90-beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB3PQ58FF7 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HSP90AB3PQ58FF7 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HSP90AB3PQ58FF7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HSP90AB3PQ58FF7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HSP90AB3PQ58FF7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HSP90AB3PQ58FF7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HSP90AB3PQ58FF7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HSP90AB3PQ58FF7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HSP90AB3PQ58FF7 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
HSP90AB3PQ58FF7 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HSP90AB3PQ58FF7 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HSP90AB3PQ58FF7 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HSP90AB3PQ58FF7 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HSP90AB3PQ58FF7 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HSP90AB3PQ58FF7 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HSP90AB3PQ58FF7 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HSP90AB3PQ58FF7 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HSP90AB3PQ58FF7 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HSP90AB3PQ58FF7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HSP90AB3PQ58FF7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HSP90AB3PQ58FF7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HSP90AB3PQ58FF7 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HSP90AB3PQ58FF7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HSP90AB3PQ58FF7 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HSP90AB3PQ58FF7 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
HSP90AB3PQ58FF7 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HSP90AB3PQ58FF7 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HSP90AB3PQ58FF7 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
HSP90AB3PQ58FF7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
HSP90AB3PQ58FF7 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HSP90AB3PQ58FF7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HSP90AB3PQ58FF7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HSP90AB3PQ58FF7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
HSP90AB3PQ58FF7 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HSP90AB3PQ58FF7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HSP90AB3PQ58FF7 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HSP90AB3PQ58FF7 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HSP90AB3PQ58FF7 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HSP90AB3PQ58FF7 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HSP90AB3PQ58FF7 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
HSP90AB3PQ58FF7 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HSP90AB3PQ58FF7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HSP90AB3PQ58FF7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HSP90AB3PQ58FF7 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HSP90AB3PQ58FF7 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HSP90AB3PQ58FF7 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
HSP90AB3PQ58FF7 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HSP90AB3PQ58FF7 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
HSP90AB3PQ58FF7 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HSP90AB3PQ58FF7 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HSP90AB3PQ58FF7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
HSP90AB3PQ58FF7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HSP90AB3PQ58FF7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HSP90AB3PQ58FF7 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HSP90AB3PQ58FF7 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
HSP90AB3PQ58FF7 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
HSP90AB3PQ58FF7 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC27■■□□□ 1.91
HSP90AB3PQ58FF7 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC27■■□□□ 1.91
HSP90AB3PQ58FF7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HSP90AB3PQ58FF7 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HSP90AB3PQ58FF7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HSP90AB3PQ58FF7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HSP90AB3PQ58FF7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HSP90AB3PQ58FF7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HSP90AB3PQ58FF7 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HSP90AB3PQ58FF7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HSP90AB3PQ58FF7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HSP90AB3PQ58FF7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HSP90AB3PQ58FF7 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HSP90AB3PQ58FF7 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HSP90AB3PQ58FF7 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
HSP90AB3PQ58FF7 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
HSP90AB3PQ58FF7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HSP90AB3PQ58FF7 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HSP90AB3PQ58FF7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HSP90AB3PQ58FF7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HSP90AB3PQ58FF7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HSP90AB3PQ58FF7 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HSP90AB3PQ58FF7 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HSP90AB3PQ58FF7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HSP90AB3PQ58FF7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HSP90AB3PQ58FF7 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HSP90AB3PQ58FF7 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
HSP90AB3PQ58FF7 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HSP90AB3PQ58FF7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HSP90AB3PQ58FF7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HSP90AB3PQ58FF7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HSP90AB3PQ58FF7 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HSP90AB3PQ58FF7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HSP90AB3PQ58FF7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HSP90AB3PQ58FF7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HSP90AB3PQ58FF7 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HSP90AB3PQ58FF7 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HSP90AB3PQ58FF7 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HSP90AB3PQ58FF7 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HSP90AB3PQ58FF7 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HSP90AB3PQ58FF7 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HSP90AB3PQ58FF7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HSP90AB3PQ58FF7 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
HSP90AB3PQ58FF7 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms