Protein–RNA interactions for Protein: Q53SF7

COBLL1, Cordon-bleu protein-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COBLL1Q53SF7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COBLL1Q53SF7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COBLL1Q53SF7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COBLL1Q53SF7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COBLL1Q53SF7 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COBLL1Q53SF7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COBLL1Q53SF7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
COBLL1Q53SF7 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COBLL1Q53SF7 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COBLL1Q53SF7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COBLL1Q53SF7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COBLL1Q53SF7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COBLL1Q53SF7 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
COBLL1Q53SF7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
COBLL1Q53SF7 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
COBLL1Q53SF7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
COBLL1Q53SF7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
COBLL1Q53SF7 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
COBLL1Q53SF7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
COBLL1Q53SF7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
COBLL1Q53SF7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
COBLL1Q53SF7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
COBLL1Q53SF7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
COBLL1Q53SF7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
COBLL1Q53SF7 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
COBLL1Q53SF7 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COBLL1Q53SF7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COBLL1Q53SF7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COBLL1Q53SF7 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COBLL1Q53SF7 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COBLL1Q53SF7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COBLL1Q53SF7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COBLL1Q53SF7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COBLL1Q53SF7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COBLL1Q53SF7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COBLL1Q53SF7 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COBLL1Q53SF7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COBLL1Q53SF7 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COBLL1Q53SF7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COBLL1Q53SF7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COBLL1Q53SF7 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COBLL1Q53SF7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COBLL1Q53SF7 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COBLL1Q53SF7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COBLL1Q53SF7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COBLL1Q53SF7 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COBLL1Q53SF7 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COBLL1Q53SF7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COBLL1Q53SF7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COBLL1Q53SF7 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COBLL1Q53SF7 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COBLL1Q53SF7 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COBLL1Q53SF7 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COBLL1Q53SF7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COBLL1Q53SF7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COBLL1Q53SF7 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
COBLL1Q53SF7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COBLL1Q53SF7 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COBLL1Q53SF7 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COBLL1Q53SF7 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COBLL1Q53SF7 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COBLL1Q53SF7 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COBLL1Q53SF7 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COBLL1Q53SF7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COBLL1Q53SF7 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COBLL1Q53SF7 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COBLL1Q53SF7 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COBLL1Q53SF7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COBLL1Q53SF7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COBLL1Q53SF7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COBLL1Q53SF7 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COBLL1Q53SF7 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COBLL1Q53SF7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COBLL1Q53SF7 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COBLL1Q53SF7 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COBLL1Q53SF7 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COBLL1Q53SF7 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
COBLL1Q53SF7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COBLL1Q53SF7 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COBLL1Q53SF7 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COBLL1Q53SF7 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
COBLL1Q53SF7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COBLL1Q53SF7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COBLL1Q53SF7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COBLL1Q53SF7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COBLL1Q53SF7 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COBLL1Q53SF7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COBLL1Q53SF7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COBLL1Q53SF7 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COBLL1Q53SF7 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COBLL1Q53SF7 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COBLL1Q53SF7 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COBLL1Q53SF7 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COBLL1Q53SF7 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COBLL1Q53SF7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COBLL1Q53SF7 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COBLL1Q53SF7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COBLL1Q53SF7 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COBLL1Q53SF7 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
COBLL1Q53SF7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms