Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB6CQ53S08 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB6CQ53S08 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB6CQ53S08 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB6CQ53S08 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB6CQ53S08 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB6CQ53S08 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB6CQ53S08 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB6CQ53S08 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB6CQ53S08 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB6CQ53S08 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB6CQ53S08 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB6CQ53S08 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB6CQ53S08 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB6CQ53S08 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB6CQ53S08 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB6CQ53S08 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB6CQ53S08 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB6CQ53S08 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB6CQ53S08 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB6CQ53S08 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB6CQ53S08 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB6CQ53S08 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB6CQ53S08 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB6CQ53S08 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB6CQ53S08 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB6CQ53S08 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB6CQ53S08 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB6CQ53S08 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB6CQ53S08 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB6CQ53S08 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB6CQ53S08 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB6CQ53S08 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB6CQ53S08 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB6CQ53S08 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB6CQ53S08 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB6CQ53S08 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB6CQ53S08 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB6CQ53S08 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB6CQ53S08 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB6CQ53S08 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB6CQ53S08 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB6CQ53S08 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB6CQ53S08 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB6CQ53S08 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB6CQ53S08 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB6CQ53S08 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB6CQ53S08 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB6CQ53S08 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAB6CQ53S08 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAB6CQ53S08 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAB6CQ53S08 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAB6CQ53S08 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAB6CQ53S08 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB6CQ53S08 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB6CQ53S08 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB6CQ53S08 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB6CQ53S08 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB6CQ53S08 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB6CQ53S08 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB6CQ53S08 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB6CQ53S08 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB6CQ53S08 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB6CQ53S08 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB6CQ53S08 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB6CQ53S08 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB6CQ53S08 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB6CQ53S08 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB6CQ53S08 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB6CQ53S08 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB6CQ53S08 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB6CQ53S08 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB6CQ53S08 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB6CQ53S08 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB6CQ53S08 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB6CQ53S08 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB6CQ53S08 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB6CQ53S08 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB6CQ53S08 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB6CQ53S08 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB6CQ53S08 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB6CQ53S08 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB6CQ53S08 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB6CQ53S08 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB6CQ53S08 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB6CQ53S08 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB6CQ53S08 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB6CQ53S08 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB6CQ53S08 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB6CQ53S08 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB6CQ53S08 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB6CQ53S08 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB6CQ53S08 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB6CQ53S08 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB6CQ53S08 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB6CQ53S08 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB6CQ53S08 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB6CQ53S08 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB6CQ53S08 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB6CQ53S08 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms