Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL22Q53GT1 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL22Q53GT1 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL22Q53GT1 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL22Q53GT1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL22Q53GT1 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL22Q53GT1 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL22Q53GT1 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL22Q53GT1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL22Q53GT1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL22Q53GT1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL22Q53GT1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL22Q53GT1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL22Q53GT1 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL22Q53GT1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL22Q53GT1 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL22Q53GT1 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL22Q53GT1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL22Q53GT1 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL22Q53GT1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL22Q53GT1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL22Q53GT1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL22Q53GT1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL22Q53GT1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL22Q53GT1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL22Q53GT1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL22Q53GT1 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL22Q53GT1 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL22Q53GT1 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL22Q53GT1 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL22Q53GT1 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL22Q53GT1 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL22Q53GT1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL22Q53GT1 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL22Q53GT1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL22Q53GT1 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL22Q53GT1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL22Q53GT1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL22Q53GT1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL22Q53GT1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL22Q53GT1 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL22Q53GT1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL22Q53GT1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL22Q53GT1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL22Q53GT1 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL22Q53GT1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL22Q53GT1 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL22Q53GT1 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL22Q53GT1 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL22Q53GT1 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL22Q53GT1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL22Q53GT1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL22Q53GT1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL22Q53GT1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL22Q53GT1 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL22Q53GT1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL22Q53GT1 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
KLHL22Q53GT1 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
KLHL22Q53GT1 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL22Q53GT1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL22Q53GT1 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL22Q53GT1 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL22Q53GT1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL22Q53GT1 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL22Q53GT1 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL22Q53GT1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL22Q53GT1 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL22Q53GT1 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL22Q53GT1 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL22Q53GT1 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL22Q53GT1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL22Q53GT1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL22Q53GT1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL22Q53GT1 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL22Q53GT1 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL22Q53GT1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL22Q53GT1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL22Q53GT1 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL22Q53GT1 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL22Q53GT1 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL22Q53GT1 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL22Q53GT1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL22Q53GT1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL22Q53GT1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL22Q53GT1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL22Q53GT1 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL22Q53GT1 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL22Q53GT1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL22Q53GT1 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL22Q53GT1 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL22Q53GT1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL22Q53GT1 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL22Q53GT1 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL22Q53GT1 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL22Q53GT1 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL22Q53GT1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL22Q53GT1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL22Q53GT1 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL22Q53GT1 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL22Q53GT1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.9 ms