Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PKDCCQ504Y2 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PKDCCQ504Y2 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PKDCCQ504Y2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PKDCCQ504Y2 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PKDCCQ504Y2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PKDCCQ504Y2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PKDCCQ504Y2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PKDCCQ504Y2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PKDCCQ504Y2 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PKDCCQ504Y2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PKDCCQ504Y2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PKDCCQ504Y2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PKDCCQ504Y2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PKDCCQ504Y2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PKDCCQ504Y2 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PKDCCQ504Y2 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PKDCCQ504Y2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKDCCQ504Y2 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKDCCQ504Y2 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKDCCQ504Y2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PKDCCQ504Y2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKDCCQ504Y2 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKDCCQ504Y2 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKDCCQ504Y2 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKDCCQ504Y2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKDCCQ504Y2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKDCCQ504Y2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKDCCQ504Y2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKDCCQ504Y2 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKDCCQ504Y2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKDCCQ504Y2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKDCCQ504Y2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKDCCQ504Y2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PKDCCQ504Y2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKDCCQ504Y2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKDCCQ504Y2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKDCCQ504Y2 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKDCCQ504Y2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKDCCQ504Y2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKDCCQ504Y2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKDCCQ504Y2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKDCCQ504Y2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKDCCQ504Y2 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKDCCQ504Y2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKDCCQ504Y2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKDCCQ504Y2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKDCCQ504Y2 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKDCCQ504Y2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKDCCQ504Y2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKDCCQ504Y2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKDCCQ504Y2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKDCCQ504Y2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKDCCQ504Y2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKDCCQ504Y2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKDCCQ504Y2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKDCCQ504Y2 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKDCCQ504Y2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PKDCCQ504Y2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PKDCCQ504Y2 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PKDCCQ504Y2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PKDCCQ504Y2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PKDCCQ504Y2 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PKDCCQ504Y2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PKDCCQ504Y2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PKDCCQ504Y2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PKDCCQ504Y2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PKDCCQ504Y2 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PKDCCQ504Y2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PKDCCQ504Y2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PKDCCQ504Y2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PKDCCQ504Y2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PKDCCQ504Y2 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PKDCCQ504Y2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PKDCCQ504Y2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PKDCCQ504Y2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PKDCCQ504Y2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PKDCCQ504Y2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PKDCCQ504Y2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PKDCCQ504Y2 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PKDCCQ504Y2 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PKDCCQ504Y2 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PKDCCQ504Y2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PKDCCQ504Y2 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PKDCCQ504Y2 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PKDCCQ504Y2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PKDCCQ504Y2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PKDCCQ504Y2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PKDCCQ504Y2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PKDCCQ504Y2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PKDCCQ504Y2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PKDCCQ504Y2 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PKDCCQ504Y2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PKDCCQ504Y2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PKDCCQ504Y2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PKDCCQ504Y2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PKDCCQ504Y2 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PKDCCQ504Y2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PKDCCQ504Y2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PKDCCQ504Y2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms