Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZHG4

FNDC1, Fibronectin type III domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC1Q4ZHG4 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FNDC1Q4ZHG4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FNDC1Q4ZHG4 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FNDC1Q4ZHG4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FNDC1Q4ZHG4 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FNDC1Q4ZHG4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FNDC1Q4ZHG4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FNDC1Q4ZHG4 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FNDC1Q4ZHG4 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
FNDC1Q4ZHG4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FNDC1Q4ZHG4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FNDC1Q4ZHG4 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FNDC1Q4ZHG4 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FNDC1Q4ZHG4 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
FNDC1Q4ZHG4 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FNDC1Q4ZHG4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FNDC1Q4ZHG4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FNDC1Q4ZHG4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FNDC1Q4ZHG4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FNDC1Q4ZHG4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FNDC1Q4ZHG4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FNDC1Q4ZHG4 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FNDC1Q4ZHG4 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FNDC1Q4ZHG4 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
FNDC1Q4ZHG4 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FNDC1Q4ZHG4 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FNDC1Q4ZHG4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FNDC1Q4ZHG4 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FNDC1Q4ZHG4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FNDC1Q4ZHG4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FNDC1Q4ZHG4 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FNDC1Q4ZHG4 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
FNDC1Q4ZHG4 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
FNDC1Q4ZHG4 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
FNDC1Q4ZHG4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FNDC1Q4ZHG4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FNDC1Q4ZHG4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FNDC1Q4ZHG4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
FNDC1Q4ZHG4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FNDC1Q4ZHG4 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
FNDC1Q4ZHG4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FNDC1Q4ZHG4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FNDC1Q4ZHG4 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FNDC1Q4ZHG4 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
FNDC1Q4ZHG4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FNDC1Q4ZHG4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FNDC1Q4ZHG4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FNDC1Q4ZHG4 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FNDC1Q4ZHG4 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FNDC1Q4ZHG4 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FNDC1Q4ZHG4 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FNDC1Q4ZHG4 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FNDC1Q4ZHG4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FNDC1Q4ZHG4 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FNDC1Q4ZHG4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FNDC1Q4ZHG4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FNDC1Q4ZHG4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FNDC1Q4ZHG4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FNDC1Q4ZHG4 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FNDC1Q4ZHG4 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FNDC1Q4ZHG4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FNDC1Q4ZHG4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FNDC1Q4ZHG4 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FNDC1Q4ZHG4 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FNDC1Q4ZHG4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FNDC1Q4ZHG4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FNDC1Q4ZHG4 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FNDC1Q4ZHG4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FNDC1Q4ZHG4 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FNDC1Q4ZHG4 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FNDC1Q4ZHG4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FNDC1Q4ZHG4 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FNDC1Q4ZHG4 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FNDC1Q4ZHG4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FNDC1Q4ZHG4 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FNDC1Q4ZHG4 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FNDC1Q4ZHG4 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FNDC1Q4ZHG4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FNDC1Q4ZHG4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FNDC1Q4ZHG4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FNDC1Q4ZHG4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FNDC1Q4ZHG4 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FNDC1Q4ZHG4 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
FNDC1Q4ZHG4 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FNDC1Q4ZHG4 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FNDC1Q4ZHG4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FNDC1Q4ZHG4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FNDC1Q4ZHG4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FNDC1Q4ZHG4 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FNDC1Q4ZHG4 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FNDC1Q4ZHG4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FNDC1Q4ZHG4 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FNDC1Q4ZHG4 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FNDC1Q4ZHG4 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FNDC1Q4ZHG4 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FNDC1Q4ZHG4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FNDC1Q4ZHG4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FNDC1Q4ZHG4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FNDC1Q4ZHG4 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
FNDC1Q4ZHG4 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 814 ms