Protein–RNA interactions for Protein: Q4VXU2

PABPC1L, Polyadenylate-binding protein 1-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC1LQ4VXU2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PABPC1LQ4VXU2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PABPC1LQ4VXU2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PABPC1LQ4VXU2 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PABPC1LQ4VXU2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PABPC1LQ4VXU2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PABPC1LQ4VXU2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PABPC1LQ4VXU2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PABPC1LQ4VXU2 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PABPC1LQ4VXU2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PABPC1LQ4VXU2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PABPC1LQ4VXU2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PABPC1LQ4VXU2 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PABPC1LQ4VXU2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PABPC1LQ4VXU2 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PABPC1LQ4VXU2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PABPC1LQ4VXU2 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PABPC1LQ4VXU2 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PABPC1LQ4VXU2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PABPC1LQ4VXU2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PABPC1LQ4VXU2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PABPC1LQ4VXU2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PABPC1LQ4VXU2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PABPC1LQ4VXU2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PABPC1LQ4VXU2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PABPC1LQ4VXU2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PABPC1LQ4VXU2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PABPC1LQ4VXU2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PABPC1LQ4VXU2 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PABPC1LQ4VXU2 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PABPC1LQ4VXU2 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PABPC1LQ4VXU2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PABPC1LQ4VXU2 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PABPC1LQ4VXU2 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PABPC1LQ4VXU2 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PABPC1LQ4VXU2 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PABPC1LQ4VXU2 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PABPC1LQ4VXU2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PABPC1LQ4VXU2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PABPC1LQ4VXU2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PABPC1LQ4VXU2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PABPC1LQ4VXU2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PABPC1LQ4VXU2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PABPC1LQ4VXU2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PABPC1LQ4VXU2 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PABPC1LQ4VXU2 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PABPC1LQ4VXU2 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PABPC1LQ4VXU2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PABPC1LQ4VXU2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PABPC1LQ4VXU2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PABPC1LQ4VXU2 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PABPC1LQ4VXU2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PABPC1LQ4VXU2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PABPC1LQ4VXU2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PABPC1LQ4VXU2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PABPC1LQ4VXU2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PABPC1LQ4VXU2 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PABPC1LQ4VXU2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PABPC1LQ4VXU2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PABPC1LQ4VXU2 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PABPC1LQ4VXU2 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PABPC1LQ4VXU2 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PABPC1LQ4VXU2 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PABPC1LQ4VXU2 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PABPC1LQ4VXU2 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PABPC1LQ4VXU2 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PABPC1LQ4VXU2 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PABPC1LQ4VXU2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PABPC1LQ4VXU2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PABPC1LQ4VXU2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PABPC1LQ4VXU2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PABPC1LQ4VXU2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PABPC1LQ4VXU2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PABPC1LQ4VXU2 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PABPC1LQ4VXU2 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PABPC1LQ4VXU2 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PABPC1LQ4VXU2 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PABPC1LQ4VXU2 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PABPC1LQ4VXU2 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PABPC1LQ4VXU2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PABPC1LQ4VXU2 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PABPC1LQ4VXU2 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PABPC1LQ4VXU2 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PABPC1LQ4VXU2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PABPC1LQ4VXU2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PABPC1LQ4VXU2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PABPC1LQ4VXU2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PABPC1LQ4VXU2 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PABPC1LQ4VXU2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PABPC1LQ4VXU2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PABPC1LQ4VXU2 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PABPC1LQ4VXU2 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PABPC1LQ4VXU2 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PABPC1LQ4VXU2 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PABPC1LQ4VXU2 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PABPC1LQ4VXU2 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PABPC1LQ4VXU2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PABPC1LQ4VXU2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PABPC1LQ4VXU2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PABPC1LQ4VXU2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms