Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DUSP28Q4G0W2 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DUSP28Q4G0W2 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
DUSP28Q4G0W2 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DUSP28Q4G0W2 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DUSP28Q4G0W2 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DUSP28Q4G0W2 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DUSP28Q4G0W2 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
DUSP28Q4G0W2 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DUSP28Q4G0W2 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
DUSP28Q4G0W2 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DUSP28Q4G0W2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DUSP28Q4G0W2 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DUSP28Q4G0W2 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DUSP28Q4G0W2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DUSP28Q4G0W2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DUSP28Q4G0W2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DUSP28Q4G0W2 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DUSP28Q4G0W2 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DUSP28Q4G0W2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DUSP28Q4G0W2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DUSP28Q4G0W2 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DUSP28Q4G0W2 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
DUSP28Q4G0W2 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DUSP28Q4G0W2 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
DUSP28Q4G0W2 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
DUSP28Q4G0W2 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DUSP28Q4G0W2 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
DUSP28Q4G0W2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DUSP28Q4G0W2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DUSP28Q4G0W2 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DUSP28Q4G0W2 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DUSP28Q4G0W2 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DUSP28Q4G0W2 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
DUSP28Q4G0W2 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DUSP28Q4G0W2 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DUSP28Q4G0W2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DUSP28Q4G0W2 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DUSP28Q4G0W2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DUSP28Q4G0W2 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DUSP28Q4G0W2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DUSP28Q4G0W2 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DUSP28Q4G0W2 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DUSP28Q4G0W2 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DUSP28Q4G0W2 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DUSP28Q4G0W2 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DUSP28Q4G0W2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DUSP28Q4G0W2 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DUSP28Q4G0W2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DUSP28Q4G0W2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DUSP28Q4G0W2 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DUSP28Q4G0W2 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DUSP28Q4G0W2 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DUSP28Q4G0W2 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DUSP28Q4G0W2 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
DUSP28Q4G0W2 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DUSP28Q4G0W2 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DUSP28Q4G0W2 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DUSP28Q4G0W2 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DUSP28Q4G0W2 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DUSP28Q4G0W2 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DUSP28Q4G0W2 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DUSP28Q4G0W2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DUSP28Q4G0W2 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DUSP28Q4G0W2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DUSP28Q4G0W2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DUSP28Q4G0W2 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DUSP28Q4G0W2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DUSP28Q4G0W2 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DUSP28Q4G0W2 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DUSP28Q4G0W2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DUSP28Q4G0W2 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DUSP28Q4G0W2 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DUSP28Q4G0W2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DUSP28Q4G0W2 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DUSP28Q4G0W2 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
DUSP28Q4G0W2 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DUSP28Q4G0W2 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DUSP28Q4G0W2 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DUSP28Q4G0W2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DUSP28Q4G0W2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DUSP28Q4G0W2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DUSP28Q4G0W2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DUSP28Q4G0W2 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DUSP28Q4G0W2 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DUSP28Q4G0W2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DUSP28Q4G0W2 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
DUSP28Q4G0W2 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
DUSP28Q4G0W2 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DUSP28Q4G0W2 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DUSP28Q4G0W2 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DUSP28Q4G0W2 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
DUSP28Q4G0W2 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
DUSP28Q4G0W2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DUSP28Q4G0W2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DUSP28Q4G0W2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DUSP28Q4G0W2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DUSP28Q4G0W2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DUSP28Q4G0W2 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DUSP28Q4G0W2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms