Protein–RNA interactions for Protein: Q49AR2

C5orf22, UPF0489 protein C5orf22, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf22Q49AR2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C5orf22Q49AR2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C5orf22Q49AR2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C5orf22Q49AR2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C5orf22Q49AR2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C5orf22Q49AR2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C5orf22Q49AR2 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C5orf22Q49AR2 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C5orf22Q49AR2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C5orf22Q49AR2 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C5orf22Q49AR2 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C5orf22Q49AR2 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C5orf22Q49AR2 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C5orf22Q49AR2 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C5orf22Q49AR2 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C5orf22Q49AR2 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C5orf22Q49AR2 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C5orf22Q49AR2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C5orf22Q49AR2 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C5orf22Q49AR2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
C5orf22Q49AR2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C5orf22Q49AR2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C5orf22Q49AR2 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C5orf22Q49AR2 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C5orf22Q49AR2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C5orf22Q49AR2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C5orf22Q49AR2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C5orf22Q49AR2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C5orf22Q49AR2 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C5orf22Q49AR2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C5orf22Q49AR2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C5orf22Q49AR2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C5orf22Q49AR2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C5orf22Q49AR2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C5orf22Q49AR2 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
C5orf22Q49AR2 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C5orf22Q49AR2 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C5orf22Q49AR2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C5orf22Q49AR2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C5orf22Q49AR2 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C5orf22Q49AR2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C5orf22Q49AR2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C5orf22Q49AR2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C5orf22Q49AR2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C5orf22Q49AR2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C5orf22Q49AR2 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C5orf22Q49AR2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C5orf22Q49AR2 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C5orf22Q49AR2 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C5orf22Q49AR2 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C5orf22Q49AR2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C5orf22Q49AR2 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C5orf22Q49AR2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C5orf22Q49AR2 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C5orf22Q49AR2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C5orf22Q49AR2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C5orf22Q49AR2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C5orf22Q49AR2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C5orf22Q49AR2 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C5orf22Q49AR2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C5orf22Q49AR2 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C5orf22Q49AR2 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C5orf22Q49AR2 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
C5orf22Q49AR2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C5orf22Q49AR2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C5orf22Q49AR2 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C5orf22Q49AR2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
C5orf22Q49AR2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C5orf22Q49AR2 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C5orf22Q49AR2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C5orf22Q49AR2 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C5orf22Q49AR2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C5orf22Q49AR2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C5orf22Q49AR2 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
C5orf22Q49AR2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C5orf22Q49AR2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C5orf22Q49AR2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C5orf22Q49AR2 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C5orf22Q49AR2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C5orf22Q49AR2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C5orf22Q49AR2 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C5orf22Q49AR2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C5orf22Q49AR2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C5orf22Q49AR2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C5orf22Q49AR2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C5orf22Q49AR2 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
C5orf22Q49AR2 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C5orf22Q49AR2 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C5orf22Q49AR2 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C5orf22Q49AR2 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22■■□□□ 1.11
C5orf22Q49AR2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C5orf22Q49AR2 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22■■□□□ 1.11
C5orf22Q49AR2 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
C5orf22Q49AR2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C5orf22Q49AR2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C5orf22Q49AR2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C5orf22Q49AR2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C5orf22Q49AR2 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C5orf22Q49AR2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C5orf22Q49AR2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 347.5 ms