Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY84

KRT71, Keratin, type II cytoskeletal 71, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT71Q3SY84 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT71Q3SY84 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT71Q3SY84 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT71Q3SY84 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT71Q3SY84 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT71Q3SY84 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT71Q3SY84 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT71Q3SY84 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT71Q3SY84 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRT71Q3SY84 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRT71Q3SY84 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRT71Q3SY84 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRT71Q3SY84 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRT71Q3SY84 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRT71Q3SY84 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRT71Q3SY84 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRT71Q3SY84 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRT71Q3SY84 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRT71Q3SY84 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRT71Q3SY84 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRT71Q3SY84 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRT71Q3SY84 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRT71Q3SY84 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRT71Q3SY84 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRT71Q3SY84 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRT71Q3SY84 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRT71Q3SY84 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRT71Q3SY84 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRT71Q3SY84 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRT71Q3SY84 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRT71Q3SY84 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRT71Q3SY84 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRT71Q3SY84 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRT71Q3SY84 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRT71Q3SY84 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRT71Q3SY84 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRT71Q3SY84 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRT71Q3SY84 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRT71Q3SY84 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRT71Q3SY84 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT71Q3SY84 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT71Q3SY84 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT71Q3SY84 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT71Q3SY84 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT71Q3SY84 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT71Q3SY84 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT71Q3SY84 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT71Q3SY84 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT71Q3SY84 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT71Q3SY84 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT71Q3SY84 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT71Q3SY84 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT71Q3SY84 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT71Q3SY84 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT71Q3SY84 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT71Q3SY84 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT71Q3SY84 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT71Q3SY84 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT71Q3SY84 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT71Q3SY84 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT71Q3SY84 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT71Q3SY84 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT71Q3SY84 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT71Q3SY84 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT71Q3SY84 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT71Q3SY84 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT71Q3SY84 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT71Q3SY84 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT71Q3SY84 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT71Q3SY84 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT71Q3SY84 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT71Q3SY84 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT71Q3SY84 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT71Q3SY84 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT71Q3SY84 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT71Q3SY84 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT71Q3SY84 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT71Q3SY84 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT71Q3SY84 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT71Q3SY84 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT71Q3SY84 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT71Q3SY84 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
KRT71Q3SY84 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KRT71Q3SY84 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT71Q3SY84 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT71Q3SY84 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT71Q3SY84 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT71Q3SY84 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT71Q3SY84 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT71Q3SY84 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT71Q3SY84 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT71Q3SY84 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT71Q3SY84 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT71Q3SY84 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT71Q3SY84 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT71Q3SY84 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT71Q3SY84 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT71Q3SY84 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT71Q3SY84 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT71Q3SY84 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms