Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TTLL9Q3SXZ7 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TTLL9Q3SXZ7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TTLL9Q3SXZ7 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TTLL9Q3SXZ7 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TTLL9Q3SXZ7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TTLL9Q3SXZ7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TTLL9Q3SXZ7 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TTLL9Q3SXZ7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TTLL9Q3SXZ7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TTLL9Q3SXZ7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TTLL9Q3SXZ7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TTLL9Q3SXZ7 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TTLL9Q3SXZ7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TTLL9Q3SXZ7 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TTLL9Q3SXZ7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TTLL9Q3SXZ7 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TTLL9Q3SXZ7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TTLL9Q3SXZ7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TTLL9Q3SXZ7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TTLL9Q3SXZ7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TTLL9Q3SXZ7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TTLL9Q3SXZ7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TTLL9Q3SXZ7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TTLL9Q3SXZ7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TTLL9Q3SXZ7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TTLL9Q3SXZ7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TTLL9Q3SXZ7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TTLL9Q3SXZ7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TTLL9Q3SXZ7 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TTLL9Q3SXZ7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TTLL9Q3SXZ7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TTLL9Q3SXZ7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TTLL9Q3SXZ7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TTLL9Q3SXZ7 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTLL9Q3SXZ7 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTLL9Q3SXZ7 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTLL9Q3SXZ7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTLL9Q3SXZ7 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTLL9Q3SXZ7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTLL9Q3SXZ7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTLL9Q3SXZ7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTLL9Q3SXZ7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTLL9Q3SXZ7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTLL9Q3SXZ7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTLL9Q3SXZ7 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TTLL9Q3SXZ7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTLL9Q3SXZ7 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTLL9Q3SXZ7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTLL9Q3SXZ7 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTLL9Q3SXZ7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTLL9Q3SXZ7 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTLL9Q3SXZ7 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTLL9Q3SXZ7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTLL9Q3SXZ7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTLL9Q3SXZ7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTLL9Q3SXZ7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TTLL9Q3SXZ7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TTLL9Q3SXZ7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TTLL9Q3SXZ7 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TTLL9Q3SXZ7 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TTLL9Q3SXZ7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TTLL9Q3SXZ7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TTLL9Q3SXZ7 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TTLL9Q3SXZ7 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TTLL9Q3SXZ7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TTLL9Q3SXZ7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TTLL9Q3SXZ7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TTLL9Q3SXZ7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TTLL9Q3SXZ7 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TTLL9Q3SXZ7 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TTLL9Q3SXZ7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TTLL9Q3SXZ7 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TTLL9Q3SXZ7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TTLL9Q3SXZ7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TTLL9Q3SXZ7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TTLL9Q3SXZ7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TTLL9Q3SXZ7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TTLL9Q3SXZ7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TTLL9Q3SXZ7 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TTLL9Q3SXZ7 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TTLL9Q3SXZ7 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TTLL9Q3SXZ7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TTLL9Q3SXZ7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TTLL9Q3SXZ7 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TTLL9Q3SXZ7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TTLL9Q3SXZ7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TTLL9Q3SXZ7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TTLL9Q3SXZ7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TTLL9Q3SXZ7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TTLL9Q3SXZ7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TTLL9Q3SXZ7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TTLL9Q3SXZ7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TTLL9Q3SXZ7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TTLL9Q3SXZ7 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TTLL9Q3SXZ7 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TTLL9Q3SXZ7 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TTLL9Q3SXZ7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TTLL9Q3SXZ7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TTLL9Q3SXZ7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms