Protein–RNA interactions for Protein: Q32MZ4

LRRFIP1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 808 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRFIP1Q32MZ4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRFIP1Q32MZ4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRFIP1Q32MZ4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRFIP1Q32MZ4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRFIP1Q32MZ4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRFIP1Q32MZ4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRFIP1Q32MZ4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRFIP1Q32MZ4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRFIP1Q32MZ4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRFIP1Q32MZ4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRFIP1Q32MZ4 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRFIP1Q32MZ4 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRFIP1Q32MZ4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRFIP1Q32MZ4 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRFIP1Q32MZ4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRFIP1Q32MZ4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRFIP1Q32MZ4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRFIP1Q32MZ4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRFIP1Q32MZ4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRFIP1Q32MZ4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRFIP1Q32MZ4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRFIP1Q32MZ4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRFIP1Q32MZ4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRFIP1Q32MZ4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRFIP1Q32MZ4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRFIP1Q32MZ4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRFIP1Q32MZ4 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRFIP1Q32MZ4 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRFIP1Q32MZ4 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRFIP1Q32MZ4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRFIP1Q32MZ4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRFIP1Q32MZ4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRFIP1Q32MZ4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRFIP1Q32MZ4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRFIP1Q32MZ4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRFIP1Q32MZ4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRFIP1Q32MZ4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRFIP1Q32MZ4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRFIP1Q32MZ4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRFIP1Q32MZ4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRFIP1Q32MZ4 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRFIP1Q32MZ4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRFIP1Q32MZ4 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRFIP1Q32MZ4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRFIP1Q32MZ4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
LRRFIP1Q32MZ4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
LRRFIP1Q32MZ4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
LRRFIP1Q32MZ4 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRFIP1Q32MZ4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRFIP1Q32MZ4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRFIP1Q32MZ4 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRFIP1Q32MZ4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRFIP1Q32MZ4 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRFIP1Q32MZ4 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRFIP1Q32MZ4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRFIP1Q32MZ4 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRFIP1Q32MZ4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRFIP1Q32MZ4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRFIP1Q32MZ4 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRFIP1Q32MZ4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRFIP1Q32MZ4 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRFIP1Q32MZ4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRFIP1Q32MZ4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRFIP1Q32MZ4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRFIP1Q32MZ4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRFIP1Q32MZ4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRFIP1Q32MZ4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRFIP1Q32MZ4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRFIP1Q32MZ4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRFIP1Q32MZ4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRFIP1Q32MZ4 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRFIP1Q32MZ4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRFIP1Q32MZ4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRFIP1Q32MZ4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRFIP1Q32MZ4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRFIP1Q32MZ4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRFIP1Q32MZ4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRFIP1Q32MZ4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRFIP1Q32MZ4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRFIP1Q32MZ4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRFIP1Q32MZ4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRFIP1Q32MZ4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRFIP1Q32MZ4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRFIP1Q32MZ4 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRFIP1Q32MZ4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRFIP1Q32MZ4 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRFIP1Q32MZ4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRFIP1Q32MZ4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRFIP1Q32MZ4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRFIP1Q32MZ4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRFIP1Q32MZ4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRFIP1Q32MZ4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRFIP1Q32MZ4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRFIP1Q32MZ4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRFIP1Q32MZ4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRFIP1Q32MZ4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRFIP1Q32MZ4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRFIP1Q32MZ4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms