Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 827 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SKIDA1Q1XH10 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SKIDA1Q1XH10 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SKIDA1Q1XH10 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SKIDA1Q1XH10 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SKIDA1Q1XH10 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SKIDA1Q1XH10 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SKIDA1Q1XH10 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SKIDA1Q1XH10 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SKIDA1Q1XH10 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SKIDA1Q1XH10 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SKIDA1Q1XH10 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SKIDA1Q1XH10 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SKIDA1Q1XH10 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SKIDA1Q1XH10 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SKIDA1Q1XH10 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SKIDA1Q1XH10 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SKIDA1Q1XH10 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SKIDA1Q1XH10 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SKIDA1Q1XH10 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SKIDA1Q1XH10 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SKIDA1Q1XH10 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SKIDA1Q1XH10 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SKIDA1Q1XH10 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SKIDA1Q1XH10 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SKIDA1Q1XH10 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SKIDA1Q1XH10 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SKIDA1Q1XH10 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SKIDA1Q1XH10 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SKIDA1Q1XH10 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SKIDA1Q1XH10 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SKIDA1Q1XH10 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SKIDA1Q1XH10 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SKIDA1Q1XH10 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SKIDA1Q1XH10 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SKIDA1Q1XH10 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SKIDA1Q1XH10 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SKIDA1Q1XH10 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SKIDA1Q1XH10 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SKIDA1Q1XH10 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SKIDA1Q1XH10 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SKIDA1Q1XH10 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SKIDA1Q1XH10 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SKIDA1Q1XH10 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SKIDA1Q1XH10 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SKIDA1Q1XH10 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SKIDA1Q1XH10 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SKIDA1Q1XH10 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SKIDA1Q1XH10 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SKIDA1Q1XH10 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SKIDA1Q1XH10 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SKIDA1Q1XH10 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SKIDA1Q1XH10 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SKIDA1Q1XH10 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SKIDA1Q1XH10 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SKIDA1Q1XH10 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SKIDA1Q1XH10 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SKIDA1Q1XH10 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SKIDA1Q1XH10 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SKIDA1Q1XH10 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SKIDA1Q1XH10 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SKIDA1Q1XH10 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SKIDA1Q1XH10 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SKIDA1Q1XH10 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SKIDA1Q1XH10 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SKIDA1Q1XH10 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SKIDA1Q1XH10 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SKIDA1Q1XH10 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SKIDA1Q1XH10 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SKIDA1Q1XH10 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SKIDA1Q1XH10 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SKIDA1Q1XH10 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SKIDA1Q1XH10 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SKIDA1Q1XH10 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SKIDA1Q1XH10 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SKIDA1Q1XH10 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SKIDA1Q1XH10 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SKIDA1Q1XH10 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SKIDA1Q1XH10 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SKIDA1Q1XH10 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SKIDA1Q1XH10 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SKIDA1Q1XH10 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SKIDA1Q1XH10 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SKIDA1Q1XH10 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SKIDA1Q1XH10 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SKIDA1Q1XH10 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SKIDA1Q1XH10 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SKIDA1Q1XH10 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SKIDA1Q1XH10 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SKIDA1Q1XH10 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SKIDA1Q1XH10 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SKIDA1Q1XH10 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SKIDA1Q1XH10 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SKIDA1Q1XH10 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SKIDA1Q1XH10 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SKIDA1Q1XH10 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SKIDA1Q1XH10 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SKIDA1Q1XH10 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SKIDA1Q1XH10 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SKIDA1Q1XH10 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
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