Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GEN1Q17RS7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GEN1Q17RS7 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GEN1Q17RS7 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GEN1Q17RS7 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GEN1Q17RS7 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GEN1Q17RS7 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GEN1Q17RS7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GEN1Q17RS7 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GEN1Q17RS7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GEN1Q17RS7 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GEN1Q17RS7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GEN1Q17RS7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GEN1Q17RS7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GEN1Q17RS7 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GEN1Q17RS7 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GEN1Q17RS7 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GEN1Q17RS7 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GEN1Q17RS7 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GEN1Q17RS7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GEN1Q17RS7 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GEN1Q17RS7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GEN1Q17RS7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GEN1Q17RS7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GEN1Q17RS7 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GEN1Q17RS7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GEN1Q17RS7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GEN1Q17RS7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GEN1Q17RS7 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GEN1Q17RS7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GEN1Q17RS7 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GEN1Q17RS7 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GEN1Q17RS7 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GEN1Q17RS7 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GEN1Q17RS7 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GEN1Q17RS7 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GEN1Q17RS7 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GEN1Q17RS7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GEN1Q17RS7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GEN1Q17RS7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GEN1Q17RS7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GEN1Q17RS7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GEN1Q17RS7 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GEN1Q17RS7 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GEN1Q17RS7 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GEN1Q17RS7 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GEN1Q17RS7 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GEN1Q17RS7 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GEN1Q17RS7 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GEN1Q17RS7 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GEN1Q17RS7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GEN1Q17RS7 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GEN1Q17RS7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GEN1Q17RS7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GEN1Q17RS7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GEN1Q17RS7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GEN1Q17RS7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GEN1Q17RS7 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GEN1Q17RS7 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GEN1Q17RS7 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GEN1Q17RS7 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GEN1Q17RS7 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GEN1Q17RS7 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GEN1Q17RS7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GEN1Q17RS7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GEN1Q17RS7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GEN1Q17RS7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GEN1Q17RS7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GEN1Q17RS7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GEN1Q17RS7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GEN1Q17RS7 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GEN1Q17RS7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GEN1Q17RS7 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GEN1Q17RS7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GEN1Q17RS7 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GEN1Q17RS7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GEN1Q17RS7 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GEN1Q17RS7 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GEN1Q17RS7 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GEN1Q17RS7 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GEN1Q17RS7 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GEN1Q17RS7 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GEN1Q17RS7 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GEN1Q17RS7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GEN1Q17RS7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GEN1Q17RS7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GEN1Q17RS7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GEN1Q17RS7 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GEN1Q17RS7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GEN1Q17RS7 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GEN1Q17RS7 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GEN1Q17RS7 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GEN1Q17RS7 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GEN1Q17RS7 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GEN1Q17RS7 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GEN1Q17RS7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GEN1Q17RS7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GEN1Q17RS7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GEN1Q17RS7 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GEN1Q17RS7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
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