Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CLPPQ16740 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CLPPQ16740 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CLPPQ16740 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CLPPQ16740 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CLPPQ16740 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CLPPQ16740 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CLPPQ16740 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CLPPQ16740 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CLPPQ16740 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CLPPQ16740 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CLPPQ16740 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CLPPQ16740 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CLPPQ16740 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CLPPQ16740 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CLPPQ16740 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CLPPQ16740 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CLPPQ16740 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CLPPQ16740 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CLPPQ16740 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CLPPQ16740 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CLPPQ16740 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CLPPQ16740 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CLPPQ16740 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CLPPQ16740 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CLPPQ16740 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CLPPQ16740 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CLPPQ16740 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CLPPQ16740 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CLPPQ16740 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CLPPQ16740 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CLPPQ16740 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CLPPQ16740 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CLPPQ16740 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CLPPQ16740 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CLPPQ16740 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CLPPQ16740 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CLPPQ16740 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CLPPQ16740 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CLPPQ16740 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CLPPQ16740 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CLPPQ16740 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CLPPQ16740 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CLPPQ16740 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CLPPQ16740 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CLPPQ16740 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CLPPQ16740 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CLPPQ16740 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CLPPQ16740 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CLPPQ16740 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CLPPQ16740 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CLPPQ16740 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CLPPQ16740 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CLPPQ16740 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CLPPQ16740 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CLPPQ16740 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CLPPQ16740 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CLPPQ16740 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CLPPQ16740 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CLPPQ16740 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CLPPQ16740 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CLPPQ16740 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CLPPQ16740 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CLPPQ16740 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CLPPQ16740 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CLPPQ16740 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CLPPQ16740 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CLPPQ16740 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CLPPQ16740 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CLPPQ16740 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CLPPQ16740 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CLPPQ16740 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CLPPQ16740 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CLPPQ16740 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CLPPQ16740 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CLPPQ16740 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CLPPQ16740 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CLPPQ16740 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CLPPQ16740 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CLPPQ16740 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CLPPQ16740 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CLPPQ16740 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CLPPQ16740 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CLPPQ16740 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CLPPQ16740 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CLPPQ16740 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CLPPQ16740 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CLPPQ16740 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CLPPQ16740 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CLPPQ16740 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CLPPQ16740 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CLPPQ16740 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CLPPQ16740 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CLPPQ16740 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CLPPQ16740 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CLPPQ16740 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CLPPQ16740 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CLPPQ16740 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CLPPQ16740 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CLPPQ16740 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
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