Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATP2B3Q16720 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATP2B3Q16720 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATP2B3Q16720 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATP2B3Q16720 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
ATP2B3Q16720 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATP2B3Q16720 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATP2B3Q16720 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATP2B3Q16720 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATP2B3Q16720 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATP2B3Q16720 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATP2B3Q16720 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATP2B3Q16720 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATP2B3Q16720 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATP2B3Q16720 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATP2B3Q16720 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATP2B3Q16720 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATP2B3Q16720 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATP2B3Q16720 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATP2B3Q16720 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATP2B3Q16720 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATP2B3Q16720 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATP2B3Q16720 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATP2B3Q16720 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATP2B3Q16720 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
ATP2B3Q16720 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATP2B3Q16720 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
ATP2B3Q16720 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
ATP2B3Q16720 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
ATP2B3Q16720 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATP2B3Q16720 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATP2B3Q16720 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATP2B3Q16720 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATP2B3Q16720 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATP2B3Q16720 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATP2B3Q16720 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATP2B3Q16720 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATP2B3Q16720 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATP2B3Q16720 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATP2B3Q16720 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATP2B3Q16720 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATP2B3Q16720 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
ATP2B3Q16720 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATP2B3Q16720 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATP2B3Q16720 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATP2B3Q16720 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATP2B3Q16720 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATP2B3Q16720 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATP2B3Q16720 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATP2B3Q16720 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATP2B3Q16720 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
ATP2B3Q16720 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATP2B3Q16720 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATP2B3Q16720 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATP2B3Q16720 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
ATP2B3Q16720 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATP2B3Q16720 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATP2B3Q16720 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATP2B3Q16720 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATP2B3Q16720 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATP2B3Q16720 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATP2B3Q16720 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATP2B3Q16720 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATP2B3Q16720 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATP2B3Q16720 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATP2B3Q16720 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATP2B3Q16720 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATP2B3Q16720 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATP2B3Q16720 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATP2B3Q16720 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATP2B3Q16720 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATP2B3Q16720 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
ATP2B3Q16720 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATP2B3Q16720 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATP2B3Q16720 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATP2B3Q16720 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATP2B3Q16720 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATP2B3Q16720 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATP2B3Q16720 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATP2B3Q16720 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATP2B3Q16720 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATP2B3Q16720 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATP2B3Q16720 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATP2B3Q16720 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
ATP2B3Q16720 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATP2B3Q16720 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATP2B3Q16720 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATP2B3Q16720 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATP2B3Q16720 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATP2B3Q16720 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATP2B3Q16720 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATP2B3Q16720 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATP2B3Q16720 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATP2B3Q16720 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
ATP2B3Q16720 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATP2B3Q16720 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATP2B3Q16720 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
ATP2B3Q16720 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATP2B3Q16720 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATP2B3Q16720 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
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