Protein–RNA interactions for Protein: Q16649

NFIL3, Nuclear factor interleukin-3-regulated protein, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIL3Q16649 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NFIL3Q16649 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NFIL3Q16649 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NFIL3Q16649 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NFIL3Q16649 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NFIL3Q16649 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NFIL3Q16649 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NFIL3Q16649 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NFIL3Q16649 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NFIL3Q16649 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NFIL3Q16649 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NFIL3Q16649 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NFIL3Q16649 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NFIL3Q16649 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NFIL3Q16649 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NFIL3Q16649 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NFIL3Q16649 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NFIL3Q16649 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NFIL3Q16649 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NFIL3Q16649 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NFIL3Q16649 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NFIL3Q16649 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NFIL3Q16649 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NFIL3Q16649 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NFIL3Q16649 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NFIL3Q16649 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NFIL3Q16649 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NFIL3Q16649 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NFIL3Q16649 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NFIL3Q16649 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NFIL3Q16649 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFIL3Q16649 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFIL3Q16649 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFIL3Q16649 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFIL3Q16649 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFIL3Q16649 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFIL3Q16649 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFIL3Q16649 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFIL3Q16649 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFIL3Q16649 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFIL3Q16649 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFIL3Q16649 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFIL3Q16649 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFIL3Q16649 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFIL3Q16649 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFIL3Q16649 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NFIL3Q16649 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NFIL3Q16649 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NFIL3Q16649 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NFIL3Q16649 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NFIL3Q16649 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NFIL3Q16649 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NFIL3Q16649 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NFIL3Q16649 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NFIL3Q16649 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NFIL3Q16649 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NFIL3Q16649 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NFIL3Q16649 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NFIL3Q16649 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NFIL3Q16649 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NFIL3Q16649 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NFIL3Q16649 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NFIL3Q16649 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NFIL3Q16649 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NFIL3Q16649 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFIL3Q16649 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFIL3Q16649 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFIL3Q16649 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFIL3Q16649 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFIL3Q16649 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFIL3Q16649 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NFIL3Q16649 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NFIL3Q16649 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFIL3Q16649 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFIL3Q16649 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFIL3Q16649 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFIL3Q16649 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NFIL3Q16649 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFIL3Q16649 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFIL3Q16649 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFIL3Q16649 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFIL3Q16649 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFIL3Q16649 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFIL3Q16649 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFIL3Q16649 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NFIL3Q16649 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFIL3Q16649 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFIL3Q16649 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFIL3Q16649 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFIL3Q16649 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFIL3Q16649 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFIL3Q16649 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFIL3Q16649 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NFIL3Q16649 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFIL3Q16649 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFIL3Q16649 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFIL3Q16649 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFIL3Q16649 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFIL3Q16649 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFIL3Q16649 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms