Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZNF239Q16600 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ZNF239Q16600 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZNF239Q16600 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZNF239Q16600 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZNF239Q16600 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF239Q16600 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF239Q16600 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF239Q16600 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF239Q16600 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF239Q16600 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF239Q16600 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF239Q16600 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF239Q16600 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF239Q16600 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF239Q16600 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF239Q16600 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF239Q16600 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF239Q16600 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF239Q16600 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF239Q16600 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF239Q16600 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF239Q16600 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF239Q16600 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNF239Q16600 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNF239Q16600 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNF239Q16600 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNF239Q16600 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNF239Q16600 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNF239Q16600 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNF239Q16600 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNF239Q16600 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNF239Q16600 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNF239Q16600 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNF239Q16600 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF239Q16600 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF239Q16600 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF239Q16600 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF239Q16600 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF239Q16600 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF239Q16600 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF239Q16600 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF239Q16600 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF239Q16600 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF239Q16600 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF239Q16600 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF239Q16600 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF239Q16600 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF239Q16600 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF239Q16600 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF239Q16600 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF239Q16600 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF239Q16600 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF239Q16600 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF239Q16600 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF239Q16600 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF239Q16600 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF239Q16600 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF239Q16600 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF239Q16600 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF239Q16600 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF239Q16600 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF239Q16600 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF239Q16600 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF239Q16600 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF239Q16600 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF239Q16600 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF239Q16600 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF239Q16600 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF239Q16600 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF239Q16600 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF239Q16600 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF239Q16600 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF239Q16600 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF239Q16600 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF239Q16600 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF239Q16600 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF239Q16600 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF239Q16600 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF239Q16600 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF239Q16600 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF239Q16600 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF239Q16600 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF239Q16600 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF239Q16600 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNF239Q16600 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNF239Q16600 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNF239Q16600 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNF239Q16600 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNF239Q16600 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNF239Q16600 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNF239Q16600 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNF239Q16600 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNF239Q16600 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNF239Q16600 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNF239Q16600 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNF239Q16600 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNF239Q16600 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNF239Q16600 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNF239Q16600 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
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