Protein–RNA interactions for Protein: Q16568

CARTPT, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARTPTQ16568 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CARTPTQ16568 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
CARTPTQ16568 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CARTPTQ16568 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
CARTPTQ16568 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CARTPTQ16568 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CARTPTQ16568 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CARTPTQ16568 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CARTPTQ16568 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CARTPTQ16568 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
CARTPTQ16568 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CARTPTQ16568 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CARTPTQ16568 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CARTPTQ16568 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CARTPTQ16568 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CARTPTQ16568 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CARTPTQ16568 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CARTPTQ16568 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CARTPTQ16568 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CARTPTQ16568 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CARTPTQ16568 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CARTPTQ16568 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CARTPTQ16568 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CARTPTQ16568 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CARTPTQ16568 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CARTPTQ16568 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CARTPTQ16568 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CARTPTQ16568 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CARTPTQ16568 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CARTPTQ16568 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CARTPTQ16568 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CARTPTQ16568 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CARTPTQ16568 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CARTPTQ16568 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CARTPTQ16568 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CARTPTQ16568 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CARTPTQ16568 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CARTPTQ16568 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CARTPTQ16568 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CARTPTQ16568 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CARTPTQ16568 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CARTPTQ16568 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CARTPTQ16568 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CARTPTQ16568 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CARTPTQ16568 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CARTPTQ16568 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CARTPTQ16568 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CARTPTQ16568 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CARTPTQ16568 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CARTPTQ16568 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
CARTPTQ16568 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
CARTPTQ16568 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CARTPTQ16568 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CARTPTQ16568 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CARTPTQ16568 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CARTPTQ16568 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CARTPTQ16568 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CARTPTQ16568 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CARTPTQ16568 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CARTPTQ16568 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CARTPTQ16568 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CARTPTQ16568 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CARTPTQ16568 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CARTPTQ16568 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CARTPTQ16568 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CARTPTQ16568 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CARTPTQ16568 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CARTPTQ16568 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CARTPTQ16568 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CARTPTQ16568 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CARTPTQ16568 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CARTPTQ16568 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CARTPTQ16568 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CARTPTQ16568 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CARTPTQ16568 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CARTPTQ16568 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CARTPTQ16568 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CARTPTQ16568 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CARTPTQ16568 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CARTPTQ16568 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CARTPTQ16568 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CARTPTQ16568 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CARTPTQ16568 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CARTPTQ16568 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CARTPTQ16568 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CARTPTQ16568 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CARTPTQ16568 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CARTPTQ16568 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CARTPTQ16568 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CARTPTQ16568 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CARTPTQ16568 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CARTPTQ16568 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CARTPTQ16568 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CARTPTQ16568 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CARTPTQ16568 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CARTPTQ16568 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CARTPTQ16568 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CARTPTQ16568 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CARTPTQ16568 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CARTPTQ16568 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms