Protein–RNA interactions for Protein: Q16526

CRY1, Cryptochrome-1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY1Q16526 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
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CRY1Q16526 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRY1Q16526 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRY1Q16526 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRY1Q16526 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRY1Q16526 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRY1Q16526 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRY1Q16526 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRY1Q16526 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRY1Q16526 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRY1Q16526 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRY1Q16526 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRY1Q16526 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRY1Q16526 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRY1Q16526 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRY1Q16526 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRY1Q16526 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRY1Q16526 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRY1Q16526 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRY1Q16526 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRY1Q16526 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRY1Q16526 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRY1Q16526 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRY1Q16526 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRY1Q16526 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRY1Q16526 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
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CRY1Q16526 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRY1Q16526 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRY1Q16526 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRY1Q16526 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRY1Q16526 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CRY1Q16526 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRY1Q16526 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CRY1Q16526 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRY1Q16526 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRY1Q16526 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRY1Q16526 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRY1Q16526 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRY1Q16526 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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CRY1Q16526 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
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CRY1Q16526 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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CRY1Q16526 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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CRY1Q16526 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
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CRY1Q16526 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRY1Q16526 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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CRY1Q16526 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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CRY1Q16526 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CRY1Q16526 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRY1Q16526 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CRY1Q16526 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRY1Q16526 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CRY1Q16526 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRY1Q16526 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CRY1Q16526 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CRY1Q16526 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CRY1Q16526 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CRY1Q16526 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CRY1Q16526 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CRY1Q16526 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CRY1Q16526 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CRY1Q16526 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CRY1Q16526 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CRY1Q16526 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CRY1Q16526 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CRY1Q16526 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CRY1Q16526 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CRY1Q16526 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CRY1Q16526 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CRY1Q16526 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CRY1Q16526 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CRY1Q16526 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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