Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LAMA4Q16363 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LAMA4Q16363 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LAMA4Q16363 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
LAMA4Q16363 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LAMA4Q16363 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LAMA4Q16363 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LAMA4Q16363 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LAMA4Q16363 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LAMA4Q16363 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LAMA4Q16363 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LAMA4Q16363 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LAMA4Q16363 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LAMA4Q16363 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LAMA4Q16363 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LAMA4Q16363 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LAMA4Q16363 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LAMA4Q16363 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
LAMA4Q16363 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LAMA4Q16363 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LAMA4Q16363 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LAMA4Q16363 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LAMA4Q16363 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LAMA4Q16363 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LAMA4Q16363 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LAMA4Q16363 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LAMA4Q16363 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LAMA4Q16363 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LAMA4Q16363 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
LAMA4Q16363 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LAMA4Q16363 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LAMA4Q16363 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LAMA4Q16363 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LAMA4Q16363 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LAMA4Q16363 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LAMA4Q16363 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LAMA4Q16363 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
LAMA4Q16363 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LAMA4Q16363 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LAMA4Q16363 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LAMA4Q16363 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
LAMA4Q16363 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LAMA4Q16363 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LAMA4Q16363 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LAMA4Q16363 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LAMA4Q16363 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LAMA4Q16363 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LAMA4Q16363 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LAMA4Q16363 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LAMA4Q16363 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LAMA4Q16363 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
LAMA4Q16363 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LAMA4Q16363 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LAMA4Q16363 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LAMA4Q16363 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LAMA4Q16363 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LAMA4Q16363 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LAMA4Q16363 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LAMA4Q16363 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LAMA4Q16363 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LAMA4Q16363 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LAMA4Q16363 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LAMA4Q16363 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LAMA4Q16363 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LAMA4Q16363 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LAMA4Q16363 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LAMA4Q16363 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LAMA4Q16363 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LAMA4Q16363 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LAMA4Q16363 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LAMA4Q16363 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
LAMA4Q16363 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LAMA4Q16363 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LAMA4Q16363 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LAMA4Q16363 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LAMA4Q16363 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LAMA4Q16363 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LAMA4Q16363 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LAMA4Q16363 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LAMA4Q16363 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LAMA4Q16363 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LAMA4Q16363 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LAMA4Q16363 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LAMA4Q16363 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LAMA4Q16363 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LAMA4Q16363 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LAMA4Q16363 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LAMA4Q16363 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LAMA4Q16363 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LAMA4Q16363 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LAMA4Q16363 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LAMA4Q16363 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LAMA4Q16363 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LAMA4Q16363 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LAMA4Q16363 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LAMA4Q16363 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LAMA4Q16363 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LAMA4Q16363 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
LAMA4Q16363 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
LAMA4Q16363 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
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