Protein–RNA interactions for Protein: Q16342

PDCD2, Programmed cell death protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2Q16342 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDCD2Q16342 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDCD2Q16342 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDCD2Q16342 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDCD2Q16342 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDCD2Q16342 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDCD2Q16342 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDCD2Q16342 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDCD2Q16342 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDCD2Q16342 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDCD2Q16342 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDCD2Q16342 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDCD2Q16342 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PDCD2Q16342 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDCD2Q16342 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDCD2Q16342 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDCD2Q16342 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDCD2Q16342 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDCD2Q16342 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDCD2Q16342 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PDCD2Q16342 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PDCD2Q16342 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDCD2Q16342 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDCD2Q16342 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDCD2Q16342 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDCD2Q16342 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDCD2Q16342 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDCD2Q16342 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PDCD2Q16342 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDCD2Q16342 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDCD2Q16342 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDCD2Q16342 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDCD2Q16342 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDCD2Q16342 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDCD2Q16342 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDCD2Q16342 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDCD2Q16342 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDCD2Q16342 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDCD2Q16342 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDCD2Q16342 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDCD2Q16342 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDCD2Q16342 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDCD2Q16342 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDCD2Q16342 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDCD2Q16342 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDCD2Q16342 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDCD2Q16342 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDCD2Q16342 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDCD2Q16342 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDCD2Q16342 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDCD2Q16342 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDCD2Q16342 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDCD2Q16342 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDCD2Q16342 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDCD2Q16342 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDCD2Q16342 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PDCD2Q16342 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PDCD2Q16342 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDCD2Q16342 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDCD2Q16342 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDCD2Q16342 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDCD2Q16342 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDCD2Q16342 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PDCD2Q16342 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PDCD2Q16342 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PDCD2Q16342 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PDCD2Q16342 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PDCD2Q16342 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDCD2Q16342 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDCD2Q16342 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDCD2Q16342 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDCD2Q16342 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDCD2Q16342 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDCD2Q16342 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDCD2Q16342 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDCD2Q16342 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDCD2Q16342 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDCD2Q16342 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDCD2Q16342 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDCD2Q16342 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDCD2Q16342 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDCD2Q16342 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDCD2Q16342 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDCD2Q16342 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PDCD2Q16342 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDCD2Q16342 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDCD2Q16342 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDCD2Q16342 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDCD2Q16342 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDCD2Q16342 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDCD2Q16342 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDCD2Q16342 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDCD2Q16342 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDCD2Q16342 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDCD2Q16342 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDCD2Q16342 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDCD2Q16342 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDCD2Q16342 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDCD2Q16342 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDCD2Q16342 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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