Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC6Q16204 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC6Q16204 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC6Q16204 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC6Q16204 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC6Q16204 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC6Q16204 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC6Q16204 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC6Q16204 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC6Q16204 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC6Q16204 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC6Q16204 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC6Q16204 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC6Q16204 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC6Q16204 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC6Q16204 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC6Q16204 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC6Q16204 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC6Q16204 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC6Q16204 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC6Q16204 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC6Q16204 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC6Q16204 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC6Q16204 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC6Q16204 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC6Q16204 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC6Q16204 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC6Q16204 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC6Q16204 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC6Q16204 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC6Q16204 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC6Q16204 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCDC6Q16204 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC6Q16204 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC6Q16204 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC6Q16204 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC6Q16204 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC6Q16204 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC6Q16204 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC6Q16204 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC6Q16204 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC6Q16204 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC6Q16204 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC6Q16204 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC6Q16204 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC6Q16204 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC6Q16204 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC6Q16204 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC6Q16204 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC6Q16204 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC6Q16204 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC6Q16204 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC6Q16204 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC6Q16204 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC6Q16204 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC6Q16204 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC6Q16204 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC6Q16204 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC6Q16204 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC6Q16204 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC6Q16204 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC6Q16204 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC6Q16204 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC6Q16204 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC6Q16204 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC6Q16204 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC6Q16204 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC6Q16204 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC6Q16204 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC6Q16204 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC6Q16204 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC6Q16204 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC6Q16204 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC6Q16204 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC6Q16204 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC6Q16204 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC6Q16204 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC6Q16204 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC6Q16204 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC6Q16204 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC6Q16204 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC6Q16204 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC6Q16204 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC6Q16204 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC6Q16204 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC6Q16204 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC6Q16204 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC6Q16204 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC6Q16204 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC6Q16204 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC6Q16204 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC6Q16204 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC6Q16204 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC6Q16204 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC6Q16204 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC6Q16204 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC6Q16204 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC6Q16204 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC6Q16204 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC6Q16204 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
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