Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

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Length 529 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CHRNA2Q15822 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CHRNA2Q15822 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CHRNA2Q15822 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CHRNA2Q15822 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CHRNA2Q15822 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CHRNA2Q15822 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CHRNA2Q15822 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CHRNA2Q15822 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CHRNA2Q15822 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CHRNA2Q15822 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CHRNA2Q15822 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CHRNA2Q15822 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CHRNA2Q15822 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CHRNA2Q15822 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CHRNA2Q15822 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CHRNA2Q15822 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CHRNA2Q15822 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CHRNA2Q15822 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CHRNA2Q15822 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CHRNA2Q15822 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CHRNA2Q15822 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CHRNA2Q15822 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CHRNA2Q15822 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CHRNA2Q15822 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CHRNA2Q15822 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CHRNA2Q15822 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CHRNA2Q15822 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CHRNA2Q15822 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CHRNA2Q15822 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CHRNA2Q15822 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CHRNA2Q15822 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CHRNA2Q15822 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CHRNA2Q15822 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CHRNA2Q15822 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CHRNA2Q15822 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CHRNA2Q15822 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CHRNA2Q15822 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CHRNA2Q15822 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CHRNA2Q15822 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CHRNA2Q15822 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CHRNA2Q15822 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CHRNA2Q15822 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CHRNA2Q15822 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CHRNA2Q15822 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CHRNA2Q15822 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CHRNA2Q15822 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CHRNA2Q15822 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CHRNA2Q15822 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CHRNA2Q15822 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CHRNA2Q15822 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CHRNA2Q15822 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CHRNA2Q15822 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CHRNA2Q15822 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CHRNA2Q15822 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CHRNA2Q15822 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CHRNA2Q15822 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CHRNA2Q15822 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CHRNA2Q15822 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CHRNA2Q15822 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CHRNA2Q15822 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CHRNA2Q15822 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CHRNA2Q15822 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CHRNA2Q15822 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CHRNA2Q15822 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CHRNA2Q15822 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CHRNA2Q15822 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CHRNA2Q15822 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CHRNA2Q15822 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CHRNA2Q15822 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CHRNA2Q15822 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
CHRNA2Q15822 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CHRNA2Q15822 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CHRNA2Q15822 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CHRNA2Q15822 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CHRNA2Q15822 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CHRNA2Q15822 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CHRNA2Q15822 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CHRNA2Q15822 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CHRNA2Q15822 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CHRNA2Q15822 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CHRNA2Q15822 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CHRNA2Q15822 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CHRNA2Q15822 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CHRNA2Q15822 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CHRNA2Q15822 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CHRNA2Q15822 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CHRNA2Q15822 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CHRNA2Q15822 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CHRNA2Q15822 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CHRNA2Q15822 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CHRNA2Q15822 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CHRNA2Q15822 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CHRNA2Q15822 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CHRNA2Q15822 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CHRNA2Q15822 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CHRNA2Q15822 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CHRNA2Q15822 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CHRNA2Q15822 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CHRNA2Q15822 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
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