Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NPTX1Q15818 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NPTX1Q15818 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NPTX1Q15818 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NPTX1Q15818 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NPTX1Q15818 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NPTX1Q15818 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NPTX1Q15818 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NPTX1Q15818 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NPTX1Q15818 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NPTX1Q15818 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NPTX1Q15818 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NPTX1Q15818 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NPTX1Q15818 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NPTX1Q15818 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20■□□□□ 0.79
NPTX1Q15818 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20■□□□□ 0.79
NPTX1Q15818 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20■□□□□ 0.79
NPTX1Q15818 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20■□□□□ 0.79
NPTX1Q15818 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NPTX1Q15818 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NPTX1Q15818 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NPTX1Q15818 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NPTX1Q15818 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NPTX1Q15818 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NPTX1Q15818 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NPTX1Q15818 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NPTX1Q15818 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NPTX1Q15818 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NPTX1Q15818 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NPTX1Q15818 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NPTX1Q15818 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NPTX1Q15818 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NPTX1Q15818 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NPTX1Q15818 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NPTX1Q15818 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NPTX1Q15818 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NPTX1Q15818 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NPTX1Q15818 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NPTX1Q15818 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NPTX1Q15818 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NPTX1Q15818 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NPTX1Q15818 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NPTX1Q15818 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NPTX1Q15818 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NPTX1Q15818 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NPTX1Q15818 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NPTX1Q15818 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NPTX1Q15818 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NPTX1Q15818 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
NPTX1Q15818 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NPTX1Q15818 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NPTX1Q15818 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NPTX1Q15818 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
NPTX1Q15818 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NPTX1Q15818 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NPTX1Q15818 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NPTX1Q15818 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
NPTX1Q15818 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
NPTX1Q15818 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
NPTX1Q15818 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
NPTX1Q15818 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
NPTX1Q15818 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NPTX1Q15818 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NPTX1Q15818 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NPTX1Q15818 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NPTX1Q15818 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
NPTX1Q15818 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NPTX1Q15818 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NPTX1Q15818 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NPTX1Q15818 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NPTX1Q15818 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NPTX1Q15818 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NPTX1Q15818 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NPTX1Q15818 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NPTX1Q15818 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NPTX1Q15818 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NPTX1Q15818 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NPTX1Q15818 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NPTX1Q15818 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NPTX1Q15818 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NPTX1Q15818 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NPTX1Q15818 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NPTX1Q15818 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NPTX1Q15818 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NPTX1Q15818 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NPTX1Q15818 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NPTX1Q15818 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NPTX1Q15818 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
NPTX1Q15818 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NPTX1Q15818 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NPTX1Q15818 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NPTX1Q15818 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NPTX1Q15818 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NPTX1Q15818 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NPTX1Q15818 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NPTX1Q15818 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NPTX1Q15818 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NPTX1Q15818 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NPTX1Q15818 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NPTX1Q15818 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
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