Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIX1Q15475 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIX1Q15475 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIX1Q15475 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIX1Q15475 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIX1Q15475 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIX1Q15475 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIX1Q15475 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIX1Q15475 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIX1Q15475 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIX1Q15475 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIX1Q15475 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SIX1Q15475 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SIX1Q15475 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SIX1Q15475 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIX1Q15475 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIX1Q15475 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIX1Q15475 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIX1Q15475 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SIX1Q15475 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIX1Q15475 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIX1Q15475 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIX1Q15475 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIX1Q15475 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIX1Q15475 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIX1Q15475 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIX1Q15475 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIX1Q15475 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIX1Q15475 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIX1Q15475 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIX1Q15475 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIX1Q15475 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIX1Q15475 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIX1Q15475 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIX1Q15475 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIX1Q15475 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SIX1Q15475 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIX1Q15475 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIX1Q15475 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIX1Q15475 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIX1Q15475 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIX1Q15475 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIX1Q15475 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIX1Q15475 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIX1Q15475 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIX1Q15475 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SIX1Q15475 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIX1Q15475 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIX1Q15475 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIX1Q15475 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIX1Q15475 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIX1Q15475 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIX1Q15475 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIX1Q15475 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIX1Q15475 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIX1Q15475 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIX1Q15475 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIX1Q15475 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SIX1Q15475 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIX1Q15475 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIX1Q15475 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIX1Q15475 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIX1Q15475 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIX1Q15475 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIX1Q15475 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIX1Q15475 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIX1Q15475 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIX1Q15475 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SIX1Q15475 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SIX1Q15475 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIX1Q15475 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIX1Q15475 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIX1Q15475 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIX1Q15475 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIX1Q15475 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIX1Q15475 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIX1Q15475 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIX1Q15475 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIX1Q15475 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIX1Q15475 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIX1Q15475 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIX1Q15475 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIX1Q15475 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIX1Q15475 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SIX1Q15475 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SIX1Q15475 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SIX1Q15475 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIX1Q15475 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIX1Q15475 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIX1Q15475 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIX1Q15475 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIX1Q15475 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIX1Q15475 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIX1Q15475 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIX1Q15475 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIX1Q15475 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIX1Q15475 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIX1Q15475 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIX1Q15475 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SIX1Q15475 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
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