Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TLR1Q15399 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TLR1Q15399 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TLR1Q15399 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TLR1Q15399 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TLR1Q15399 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TLR1Q15399 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TLR1Q15399 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TLR1Q15399 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TLR1Q15399 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TLR1Q15399 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TLR1Q15399 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TLR1Q15399 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TLR1Q15399 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TLR1Q15399 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TLR1Q15399 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TLR1Q15399 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TLR1Q15399 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TLR1Q15399 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TLR1Q15399 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TLR1Q15399 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TLR1Q15399 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TLR1Q15399 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TLR1Q15399 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TLR1Q15399 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TLR1Q15399 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TLR1Q15399 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TLR1Q15399 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TLR1Q15399 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TLR1Q15399 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TLR1Q15399 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TLR1Q15399 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TLR1Q15399 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TLR1Q15399 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TLR1Q15399 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TLR1Q15399 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
TLR1Q15399 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TLR1Q15399 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TLR1Q15399 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TLR1Q15399 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TLR1Q15399 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TLR1Q15399 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
TLR1Q15399 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TLR1Q15399 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TLR1Q15399 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TLR1Q15399 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
TLR1Q15399 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
TLR1Q15399 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
TLR1Q15399 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
TLR1Q15399 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
TLR1Q15399 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
TLR1Q15399 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TLR1Q15399 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TLR1Q15399 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TLR1Q15399 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TLR1Q15399 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TLR1Q15399 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TLR1Q15399 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TLR1Q15399 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TLR1Q15399 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TLR1Q15399 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TLR1Q15399 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TLR1Q15399 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TLR1Q15399 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TLR1Q15399 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TLR1Q15399 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TLR1Q15399 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TLR1Q15399 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TLR1Q15399 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TLR1Q15399 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TLR1Q15399 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TLR1Q15399 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TLR1Q15399 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TLR1Q15399 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TLR1Q15399 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TLR1Q15399 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TLR1Q15399 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TLR1Q15399 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TLR1Q15399 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TLR1Q15399 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TLR1Q15399 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TLR1Q15399 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TLR1Q15399 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TLR1Q15399 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TLR1Q15399 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TLR1Q15399 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TLR1Q15399 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TLR1Q15399 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TLR1Q15399 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TLR1Q15399 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TLR1Q15399 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TLR1Q15399 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TLR1Q15399 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TLR1Q15399 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TLR1Q15399 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TLR1Q15399 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TLR1Q15399 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TLR1Q15399 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TLR1Q15399 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TLR1Q15399 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.5 ms