Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAM2Q15035 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAM2Q15035 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAM2Q15035 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAM2Q15035 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAM2Q15035 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAM2Q15035 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAM2Q15035 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAM2Q15035 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAM2Q15035 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAM2Q15035 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAM2Q15035 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAM2Q15035 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAM2Q15035 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAM2Q15035 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAM2Q15035 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAM2Q15035 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAM2Q15035 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAM2Q15035 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAM2Q15035 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAM2Q15035 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAM2Q15035 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAM2Q15035 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAM2Q15035 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAM2Q15035 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAM2Q15035 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAM2Q15035 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAM2Q15035 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAM2Q15035 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAM2Q15035 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAM2Q15035 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAM2Q15035 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAM2Q15035 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAM2Q15035 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAM2Q15035 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAM2Q15035 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAM2Q15035 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAM2Q15035 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAM2Q15035 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
TRAM2Q15035 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
TRAM2Q15035 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAM2Q15035 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAM2Q15035 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAM2Q15035 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAM2Q15035 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAM2Q15035 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAM2Q15035 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAM2Q15035 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAM2Q15035 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAM2Q15035 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAM2Q15035 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAM2Q15035 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAM2Q15035 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAM2Q15035 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAM2Q15035 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAM2Q15035 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAM2Q15035 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAM2Q15035 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAM2Q15035 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAM2Q15035 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAM2Q15035 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAM2Q15035 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAM2Q15035 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAM2Q15035 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAM2Q15035 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAM2Q15035 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAM2Q15035 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAM2Q15035 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAM2Q15035 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAM2Q15035 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAM2Q15035 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAM2Q15035 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAM2Q15035 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAM2Q15035 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAM2Q15035 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAM2Q15035 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAM2Q15035 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAM2Q15035 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAM2Q15035 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAM2Q15035 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAM2Q15035 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAM2Q15035 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAM2Q15035 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAM2Q15035 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAM2Q15035 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAM2Q15035 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAM2Q15035 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAM2Q15035 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAM2Q15035 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAM2Q15035 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAM2Q15035 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAM2Q15035 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAM2Q15035 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAM2Q15035 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAM2Q15035 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAM2Q15035 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAM2Q15035 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAM2Q15035 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAM2Q15035 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAM2Q15035 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
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